RNA–Protein interactions for RNA: YGL154C

LYS5, Transcript of Phosphopantetheinyl transferase involved in lysine biosynthesis, yeast

Gene LYS5, Length 819 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYS5	YGL154C	SPR28	Q04921	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SKM1	Q12469	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SUC2	P00724	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ATP6	P00854	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ABF1	P14164	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DAL81	P21657	970 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	GEX1	P25596	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	LYP1	P32487	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	AFR1	P33304	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	GEX2	P36173	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YHR218W	P38899	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SUR7	P54003	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SHR3	Q02774	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	PIR1	Q03178	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	TAF12	Q03761	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	GLO2	Q05584	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	PEX15	Q08215	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	EXO70	P19658	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	AEP2	P22136	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DBF2	P22204	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	CLB3	P24870	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YIH1	P25637	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	HEM3	P28789	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	BEM1	P29366	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YBL010C	P32788	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	TAE1	P38340	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	PCA1	P38360	1216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	GOS1	P38736	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	TRM5	P38793	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ELO1	P39540	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MTW1	P39731	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ALR2	P43553	858 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MRX6	P48564	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	COG7	P53195	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MRPL50	P53724	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	VAC7	P53950	1165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	FMN1	Q03778	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MLC2	Q06580	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MCH5	Q08777	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	GUP2	Q08929	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	HUA2	Q12134	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
LYS5	YGL154C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	GPA2	P10823	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	INO1	P11986	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	KSS1	P14681	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	PMA2	P19657	947 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	CLN2	P20438	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	KAR4	P25583	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	FUN30	P31380	1131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MRP4	P32902	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	NIC96	P34077	839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	CLG1	P35190	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	CSG2	P35206	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SET3	P36124	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	MRPL17	P36528	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YBR032W	P38223	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SLM4	P38247	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SDH8	P38345	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	VMA7	P39111	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	STL1	P39932	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	DDI1	P40087	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ELP2	P42935	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	SNZ3	P43545	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	FMP32	P43557	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ATG36	P46983	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YJL049W	P47048	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	AMA1	P50082	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	EMC4	P53073	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	PEF1	P53238	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	YGR111W	P53265	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYS5	YGL154C	ZRG17	P53735	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 108.7 ms