RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	RIM20	Q12033	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RPH1	P39956	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MRPL19	P53875	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MET17	P06106	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	EXO70	P19658	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ATP11	P32453	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	CMC1	P36064	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YJL213W	P40896	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YDL186W	P48568	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	IRC15	Q02733	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	VPS74	Q06385	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	CKA1	P15790	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YCR022C	P25620	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	PMT1	P33775	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	SHO1	P40073	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	JJJ1	P53863	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	SLG1	P54867	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	AYT1	Q12226	474 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RTP1	Q12751	981 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	INH1	P01097	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	KRE9	P39005	276 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	POP1	P41812	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	HXT14	P42833	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	ELP2	P42935	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	MDM1	Q01846	1127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	RKM5	Q12367	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	CYB2	P00175	591 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	ROX1	P25042	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	AGA1	P32323	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	SEC66	P33754	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	PMU1	P36069	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	ALG8	P40351	577 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	COS10	P52924	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	YGL108C	P53139	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	GRX6	Q12438	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	HEM2	P05373	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	HAT2	P39984	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	SYG1	P40528	902 aa		4.81	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	GWT1	P47026	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	ATR1	P13090	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	RED1	P14291	827 aa		4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	TUL1	P36096	758 aa		4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	SMF1	P38925	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	TAF11	Q04226	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	TAP42	Q04372	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	BUB3	P26449	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	FAU1	P40099	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	URB2	P47108	1174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	SCW10	Q04951	389 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	RTN2	Q12443	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	RAD14	P28519	371 aa		4.78	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	AFG1	P32317	509 aa		4.78	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	CBP4	P37267	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	YHR218W	P38899	603 aa		4.78	□□□□□ -1.64
snR34	snR34	CPR3	P25719	182 aa		4.77	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RSM22	P36056	628 aa		4.77	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YGR149W	P48236	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	WSC2	P53832	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
snR34	snR34	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RHO2	P06781	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	FRE2	P36033	711 aa		4.76	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	CTF3	Q12748	733 aa		4.76	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	ATP10	P18496	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	ERG3	P32353	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	JNM1	P36224	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	SRB7	P47822	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YLR287C	Q05881	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RRD2	Q12461	358 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	SPS4	P09937	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	PPH22	P23595	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	THI2	P38141	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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