RNA–Protein interactions for RNA: YKR057W

RPS21A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS21A, Length 264 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS21A	YKR057W	AIM32	Q04689	311 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	RIF2	Q06208	395 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	CRN1	Q06440	651 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	VPS36	Q06696	566 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	SWC7	Q06707	132 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	GRS2	Q06817	618 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	MCA1	Q08601	432 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	TRE2	Q08693	809 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	PGC1	Q08959	321 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	RBD2	Q12270	262 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	CTF3	Q12748	733 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	MDM12	Q92328	271 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPS21A	YKR057W	STT4	P37297	1900 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	HEM2	P05373	342 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ALG7	P07286	448 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MSM1	P22438	575 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	OCA4	P25366	362 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	PEX34	P25584	144 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	CPR3	P25719	182 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	RAD27	P26793	382 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	CDC5	P32562	705 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SDH3	P33421	198 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SCD5	P34758	872 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	TAF14	P35189	244 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	NAT2	P37293	288 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	KTR4	P38131	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	YBR137W	P38276	179 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	IFA38	P38286	347 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ATG7	P38862	630 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ACO2	P39533	789 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	COG3	P40094	801 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SOK1	P40317	901 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
RPS21A	YKR057W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MNN5	P46982	586 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	SSY5	P47002	699 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	BIT61	P47041	543 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	IRC18	P47056	224 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ROM1	P53046	1155 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MET13	P53128	600 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	IGO1	P53897	168 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	NUP49	Q02199	472 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	YPL034W	Q03083	165 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	PEX29	Q03370	554 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	TAF12	Q03761	539 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ECM11	Q04110	302 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	PPN1	Q04119	674 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	RCO1	Q04779	684 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	GRX8	Q05926	109 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	DCS1	Q06151	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	PHO92	Q06390	306 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ARO10	Q06408	635 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MFG1	Q07684	458 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	AAD4	Q07747	329 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	THP1	Q08231	455 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	YNG1	Q08465	219 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ENV7	Q12003	364 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	NUS1	Q12063	375 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MCD1	Q12158	566 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
RPS21A	YKR057W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	PNS1	Q12412	539 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	WHI5	Q12416	295 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	ATG31	Q12421	196 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	LDB19	Q12502	818 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	TSC13	Q99190	310 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	MAS1	P10507	462 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	GAL3	P13045	520 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	GAL2	P13181	574 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPS21A	YKR057W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9

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