RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	COQ6	P53318	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PRM1	P53835	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TEP1	P53916	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	UBX4	P54730	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TFB2	Q02939	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	NHP10	Q03435	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ARP9	Q05123	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	COQ11	Q05892	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	BLS1	Q06071	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SFH1	Q06168	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YET3	Q07451	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ATG34	Q12292	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	GTT2	Q12390	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RGS2	Q99188	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	COX5A	P00424	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HIP1	P06775	603 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RSR1	P13856	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CPR4	YCR069W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	DAL81	P21657	970 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	GPI10	P30777	616 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	AEP1	P32493	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PXA2	P34230	853 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YHR182W	P38870	785 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	DUN1	P39009	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	OSW5	P40219	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YJR061W	P40355	935 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	IME4	P41833	600 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TDA10	P42938	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YJL107C	P42947	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YFR018C	P43599	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	AIM23	P47015	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	INA17	Q02888	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TRS31	Q03337	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PPN1	Q04119	674 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MCP2	Q06567	569 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	LDB17	Q12342	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PEX11	Q12462	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HEM2	P05373	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	ABF1	P14164	731 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	NMT1	P14743	455 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	CLN1	P20437	546 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	SNT1	P25357	1226 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	DEP1	P31385	405 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	TOA1	P32773	286 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YKL100C	P34248	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
CPR4	YCR069W	LDB7	P38210	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YBR032W	P38223	100 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	SEO1	P39709	593 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	PIG2	P40187	538 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	PEP8	P40335	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	UBP7	P40453	1071 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	ATG36	P46983	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	SPC105	P53148	917 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YNL144C	P53907	740 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YNL143C	P53908	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	NUP100	Q02629	959 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	OCA6	Q12454	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	PRP28	P23394	588 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	DCC1	P25559	380 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	GEX1	P25596	615 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	PPG1	P32838	368 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	CYM1	P32898	989 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	GMH1	P36125	273 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	GEX2	P36173	615 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	RIM2	P38127	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YHI9	P38765	294 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	CCT6	P39079	546 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	MRX1	P40050	688 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	FAR3	P46671	204 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	YGR151C	P53287	111 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	BUD32	P53323	261 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	BIO4	P53630	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR4	YCR069W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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