RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 NAIPQ13075 1403 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN6O43657 245 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 NEFMP07197 916 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 PPP2R5AQ15172 486 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 FAM209AQ5JX71 171 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 ZAR1Q86SH2 424 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
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CCL20-201ENST00000358813 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 ISL2Q96A47 359 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 APBA2Q99767 749 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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CCL20-201ENST00000358813 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-201ENST00000358813 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PXDNQ92626 1479 aa7.15□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 KIF1BO60333 1816 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PQU0 124 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 FANCGO15287 622 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 SLIT2O94813 1529 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 RASGRP1O95267 797 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 F13BP05160 661 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PGRP06401 933 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 LAMC1P11047 1609 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 ADMP35318 185 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 KIF1AQ12756 1690 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 BIRC2Q13490 618 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 SPON1Q9HCB6 807 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 TGFB1P01137 390 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 RING1Q06587 406 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 CDK5R2Q13319 367 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 RGL3Q3MIN7 710 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 SHISA5Q8N114 240 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 FAM170BA6NMN3 283 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 NPTXRO95502 500 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 GRK4P32298 578 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 CYP27A1Q02318 531 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 GATA6Q92908 595 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 CLTCL1P53675 1640 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 PRR19A6NJB7 356 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCL20-201ENST00000358813 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 PPP2R2AP63151 447 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 MCL1Q07820 350 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-201ENST00000358813 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.11□□□□□ -1.27
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