RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ATR1P13090 542 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RPN12P32496 274 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SEC66P33754 206 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CMC1P36064 111 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ESL1P40456 1118 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MET18P40469 1032 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SLG1P54867 378 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA VPS72Q03388 795 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA PDS5Q04264 1277 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA COG4Q06096 861 aa2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MRD1Q06106 887 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SHO1P40073 367 aa2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ELP2P42935 788 aa2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA JJJ1P53863 590 aa2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RIM20Q12033 661 aa2.88□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GDH1P07262 454 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA PMU1P36069 295 aa2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YBP1P38315 674 aa2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ALG8P40351 577 aa2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YJL132WP47014 750 aa2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA AYT1Q12226 474 aa2.87□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MES1P00958 751 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CKA1P15790 372 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CPR3P25719 182 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ATS1P31386 333 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ATP11P32453 318 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YOX1P34161 385 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CBP4P37267 147 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA HAT2P39984 401 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA NDE1P40215 560 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA HXT14P42833 540 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MRPL19P53875 158 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YML133CQ03099 1374 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YLL067CQ07888 1374 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YLL066CQ99208 1374 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YCR022CP25620 114 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GPI10P30777 616 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GYP6P32806 458 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA TUL1P36096 758 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA OTU2P38747 307 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA FAU1P40099 211 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA POP1P41812 875 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GWT1P47026 490 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YGL108CP53139 140 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA TAP42Q04372 366 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GRX6Q12438 231 aa2.86□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA HEM2P05373 342 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CDC31P06704 161 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RHO2P06781 192 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA ROX1P25042 368 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RAD14P28519 371 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA PMT1P33775 817 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YHR218WP38899 603 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SMF1P38925 575 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA KRE9P39005 276 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SYG1P40528 902 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA IDP2P41939 412 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SOV1Q04748 898 aa2.85□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA LEU4P06208 619 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA BUB3P26449 341 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CRM1P30822 1084 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA AGA1P32323 725 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA SRB7P47822 140 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA MDM1Q01846 1127 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA TAF11Q04226 346 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA RKM5Q12367 367 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA CTF3Q12748 733 aa2.84□□□□□ -1.95
15S_rRNA15S_rRNA INH1P01097 85 aa2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA MET17P06106 444 aa2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA AFG1P32317 509 aa2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA REC114P32841 428 aa2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA RSM22P36056 628 aa2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.83□□□□□ -1.96not detected
15S_rRNA15S_rRNA SPS4P09937 338 aa2.82□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA RED1P14291 827 aa2.82□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
15S_rRNA15S_rRNA FRE2P36033 711 aa2.82□□□□□ -1.96
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