RNA–Protein interactions for RNA: YJR069C

HAM1, Transcript of Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, yeastyeast

Gene HAM1, Length 594 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAM1YJR069C MGA2P40578 1113 aa10.28□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HAM1YJR069C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HAM1YJR069C HAP1P0CE41 1502 aa10.24□□□□□ -0.77
HAM1YJR069C BDF1P35817 686 aa10.23□□□□□ -0.77
HAM1YJR069C MHP1P43638 1398 aa10.21□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.19□□□□□ -0.78 RIP-Chip
HAM1YJR069C SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C IPL1P38991 367 aa10.17□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C CST9Q06032 482 aa10.17□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C URN1Q06525 465 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C ESL2P36168 1195 aa10.15□□□□□ -0.78
HAM1YJR069C TYS1P36421 394 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C ENP1P38333 483 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C SPT7P35177 1332 aa10.13□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C DNF3Q12674 1656 aa10.13□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C TAF5P38129 798 aa10.11□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C BCK1Q01389 1478 aa10.1□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C YAP3P38749 330 aa10.1□□□□□ -0.79
HAM1YJR069C KIP3P53086 805 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HAM1YJR069C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HAM1YJR069C ALD4P46367 519 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HAM1YJR069C RAD9P14737 1309 aa10.03□□□□□ -0.8
HAM1YJR069C MRM1P25270 412 aa10.02□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C SCT1P32784 759 aa10.02□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C PDS5Q04264 1277 aa10.01□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C SPE2P21182 396 aa10□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C DMA1P38823 416 aa9.98□□□□□ -0.81
HAM1YJR069C TAF8Q03750 510 aa9.96□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C TGL3P40308 642 aa9.93□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C CAB1Q04430 367 aa9.93□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C PRS1P32895 427 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C NAP1P25293 417 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C NST1P53935 1240 aa9.9□□□□□ -0.82
HAM1YJR069C KRE5P22023 1365 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C YML133CQ03099 1374 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C YLL067CQ07888 1374 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C YLL066CQ99208 1374 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C LEU3P08638 886 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C RTG3P38165 486 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C FKH1P40466 484 aa9.89□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C MAK10Q02197 733 aa9.87□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C PSK1P31374 1356 aa9.86□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C MRX12P47084 519 aa9.85□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C USO1P25386 1790 aa9.85□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C NOP2P40991 618 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C IOC4Q04213 475 aa9.84□□□□□ -0.83
HAM1YJR069C RCR1P38212 213 aa9.83□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C RIA1P53893 1110 aa9.82□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C SNF2P22082 1703 aa9.8□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C RAM2P29703 316 aa9.8□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C VPS29P38759 282 aa9.78□□□□□ -0.84
HAM1YJR069C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C RCM1P53972 490 aa9.77□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C PPH3P32345 308 aa9.76□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C RPP0P05317 312 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C TRK1P12685 1235 aa9.74□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C CPS1P27614 576 aa9.74□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C YAP5P40574 245 aa9.73□□□□□ -0.85
HAM1YJR069C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.73□□□□□ -0.85not detected
HAM1YJR069C TAP42Q04372 366 aa9.71□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C TY4B-HP0C2J7 1802 aa9.7□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C TY4B-JP47024 1803 aa9.7□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C VPS27P40343 622 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C CDC45Q08032 650 aa9.69□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C YOR238WQ08634 303 aa9.69□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C AUS1Q08409 1394 aa9.68□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C PDI1P17967 522 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C PRP43P53131 767 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C APC1P53886 1748 aa9.65□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C YMR196WQ04336 1088 aa9.65□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C YDL144CQ07589 356 aa9.65□□□□□ -0.86
HAM1YJR069C GRX4P32642 244 aa9.64□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C STS1P38637 319 aa9.64□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C YIL177CP40434 1758 aa9.63□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C YJL225CP40889 1758 aa9.63□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C KAR2P16474 682 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C YRF1-2P40105 1681 aa9.63□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C MST1P07236 462 aa9.62□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C YFR006WP43590 535 aa9.61□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C RTF1P53064 558 aa9.61□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C MPP10P47083 593 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C HIM1Q06674 414 aa9.6□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.7 ms