RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	PEP12	P32854	288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	ERP5	P38819	212 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	SIT4	P20604	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	ESS1	P22696	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	POL32	P47110	350 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	CSC1	Q06538	782 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	ARG8	P18544	423 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	LAM6	Q08001	693 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	SAM3	Q08986	587 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	SOL3	P38858	249 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	RSC30	P38781	883 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBP12	YJL197W	YJU3	P28321	313 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YHL050C	P38721	697 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YHR219W	P38900	624 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	CST6	P40535	587 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	KAR5	Q04746	504 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	GAL2	P13181	574 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	ATE1	P16639	503 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	ECM23	Q02710	187 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	SCJ1	P25303	377 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YAP5	P40574	245 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	ATG1	P53104	897 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	NST1	P53935	1240 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YPR109W	Q06104	294 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	TFB4	Q12004	338 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	MDJ2	P42834	146 aa		5	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	ATG36	P46983	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	RTS3	P53289	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	MGE1	P38523	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	YJR107W	P47145	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	AI4	P03878	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	STB3	Q12427	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	MCM16	Q12262	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	GYP5	Q12344	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	UBX7	P38349	436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
UBP12	YJL197W	OSW7	P43611	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	WHI5	Q12416	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	RTF1	P53064	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	SEC8	P32855	1065 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	RNH70	P53331	553 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBP12	YJL197W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	ACF4	P47129	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	PHO87	P25360	923 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	ATG3	P40344	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	YJL049W	P47048	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	THI12	P42883	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	THI5	P43534	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	THI11	P47183	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	THI13	Q07748	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	HAP4	P14064	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	SWE1	P32944	819 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	YCK3	P39962	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	KTR7	P40504	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	SLY41	P22215	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	YNL115C	P53925	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	VPS72	Q03388	795 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	PIB1	Q06651	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	SRS2	P12954	1174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	RMD1	Q03441	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	ENV9	Q08651	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	PNP1	Q05788	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	NUT2	Q06213	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	YJR008W	P47085	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	UBX5	Q06682	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	PPG1	P32838	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	TOM20	P35180	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	PEX21	P50091	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	BOL3	P39724	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	PUS6	P53294	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP12	YJL197W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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