RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.88	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	GRX4	P32642	244 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	CAB1	Q04430	367 aa		5.87	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	RLF2	Q12495	606 aa		5.86	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	MAK10	Q02197	733 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	TSC11	P40061	1430 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	RRI2	Q12348	645 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	CDC45	Q08032	650 aa		5.85	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	PRI1	P10363	409 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	CAT8	P39113	1433 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DNF2	YDR093W	IPL1	P38991	367 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	GAS4	Q08271	471 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	VPS64	Q03944	604 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	ULS1	Q08562	1619 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	ENV11	P53246	860 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	KEX1	P09620	729 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	DOP1	Q03921	1698 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	AOS1	Q06624	347 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	IRC3	Q06683	689 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	DAL5	P15365	543 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	AIM7	Q12156	149 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	YDL144C	Q07589	356 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	TCB1	Q12466	1186 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	ITT1	Q04638	464 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	ISW2	Q08773	1120 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	VPS15	P22219	1454 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	YFR006W	P43590	535 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	YBP2	P53169	641 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	MDG1	P53885	366 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	RCM1	P53972	490 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	MHP1	P43638	1398 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	YPR148C	Q06523	435 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	PEX14	P53112	341 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	GDB1	Q06625	1536 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	UGA2	P38067	497 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	DNF2	Q12675	1612 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DNF2	YDR093W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	CAB3	P36076	571 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	YLH47	Q06493	454 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	AVT3	P36062	692 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	SAP155	P43612	1002 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	ALD3	P54114	506 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RMD1	Q03441	430 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	BUD3	P25558	1636 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
DNF2	YDR093W	RAD9	P14737	1309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	PDR10	P51533	1564 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	TRM3	Q07527	1436 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RPC31	P17890	251 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RAD26	P40352	1085 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	SPT7	P35177	1332 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	NUP170	P38181	1502 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	SMC1	P32908	1225 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	PBY1	P38254	753 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RMT2	Q03305	412 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	SWI6	P09959	803 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.73	□□□□□ -1.49	not detected
DNF2	YDR093W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	YBT1	P32386	1661 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.73	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	TPD3	P31383	635 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	MAM1	P40065	302 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	ALD2	P47771	506 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	YKL133C	P36066	463 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	DOS2	P54858	310 aa		5.71	□□□□□ -1.49

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