RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629943.2

PCBP1-AS1-355, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 725 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NLRP6P59044 892 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KIF3CO14782 793 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MFRPQ9BY79 579 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PTGER2P43116 358 aa10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ARSIQ5FYB1 569 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 STK24Q9Y6E0 443 aa10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLC34A2O95436 690 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 C2orf72A6NCS6 295 aa10.08□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 STK25O00506 426 aa10.08□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PBX2P40425 430 aa10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PKD2Q13563 968 aa10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RGL2O15211 777 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NUDT7P0C024 238 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEEQ6S8J3 1075 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LHX6Q9UPM6 363 aa9.98□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TMC2Q8TDI7 906 aa9.97□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PPP1R37O75864 691 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FOXK1P85037 733 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ARHGAP33O14559 1287 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TK2O00142 265 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HRO43593 1189 aa9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HCSTQ9UBK5 93 aa9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.83□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLPP6Q8IY26 295 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DSG2Q14126 1118 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TBC1D12O60347 775 aa9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PSEN2P49810 448 aa9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 OXER1Q8TDS5 423 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KCNK17Q96T54 332 aa9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KCNH8Q96L42 1107 aa9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FOSBP53539 338 aa9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IFFO2Q5TF58 517 aa9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.64□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.63□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.62□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 JPH4Q96JJ6 628 aa9.61□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 STAC3Q96MF2 364 aa9.61□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.6□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PDE4AP27815 886 aa9.59□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RGS20O76081 388 aa9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PTPREP23469 700 aa9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.57□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MFSD10Q14728 455 aa9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EVI5O60447 810 aa9.54□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.54□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.53□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PTPN5P54829 565 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 WNT2BQ93097 391 aa9.49□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NBPF3Q9H094 633 aa9.49□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 A0A0G2JS52 829 aa9.48□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.48□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.48□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.47□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.46□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.45□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MAP3K9P80192 1104 aa9.45□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PHF14O94880 888 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FBXW7Q969H0 707 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms