RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612795.1

CSNK1E-215, Transcript of casein kinase 1 epsilon, human

TSL 2

Gene CSNK1E, Length 885 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1E-215	ENST00000612795	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CSNK1E-215	ENST00000612795	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CSNK1E-215	ENST00000612795	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CSNK1E-215	ENST00000612795	PLCH2	O75038	1416 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CSNK1E-215	ENST00000612795	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CSNK1E-215	ENST00000612795	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CSNK1E-215	ENST00000612795	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CSNK1E-215	ENST00000612795	ATP10A	O60312	1499 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CSNK1E-215	ENST00000612795	KIF14	Q15058	1648 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CSNK1E-215	ENST00000612795	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	KDM5C	P41229	1560 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
CSNK1E-215	ENST00000612795	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	C3	P01024	1663 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	CLIP1	P30622	1438 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CSNK1E-215	ENST00000612795	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CSNK1E-215	ENST00000612795	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CSNK1E-215	ENST00000612795	ABCC1	P33527	1531 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CSNK1E-215	ENST00000612795	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CSNK1E-215	ENST00000612795	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	AGL	P35573	1532 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	PTPRT	O14522	1441 aa		28.5	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.49	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.47	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.45	■■■□□ 2.15
CSNK1E-215	ENST00000612795	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CSNK1E-215	ENST00000612795	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CSNK1E-215	ENST00000612795	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CSNK1E-215	ENST00000612795	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CSNK1E-215	ENST00000612795	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CSNK1E-215	ENST00000612795	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	SOCS7	O14512	581 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CSNK1E-215	ENST00000612795	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.31	■■■□□ 2.12
CSNK1E-215	ENST00000612795	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
CSNK1E-215	ENST00000612795	NPAT	Q14207	1427 aa		28.3	■■■□□ 2.12
CSNK1E-215	ENST00000612795	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
CSNK1E-215	ENST00000612795	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CSNK1E-215	ENST00000612795	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.2	■■■□□ 2.11
CSNK1E-215	ENST00000612795	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	A2M	P01023	1474 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.14	■■■□□ 2.1
CSNK1E-215	ENST00000612795	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CSNK1E-215	ENST00000612795	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CSNK1E-215	ENST00000612795	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CSNK1E-215	ENST00000612795	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CSNK1E-215	ENST00000612795	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
CSNK1E-215	ENST00000612795	PKD2	Q13563	968 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CSNK1E-215	ENST00000612795	GGT6	Q6P531	493 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CSNK1E-215	ENST00000612795	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
CSNK1E-215	ENST00000612795	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CSNK1E-215	ENST00000612795	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
CSNK1E-215	ENST00000612795	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CSNK1E-215	ENST00000612795	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CSNK1E-215	ENST00000612795	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28	■■■□□ 2.07
CSNK1E-215	ENST00000612795	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CSNK1E-215	ENST00000612795	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CSNK1E-215	ENST00000612795	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CSNK1E-215	ENST00000612795	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CSNK1E-215	ENST00000612795	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CSNK1E-215	ENST00000612795	CPS1	P31327	1500 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CSNK1E-215	ENST00000612795	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
CSNK1E-215	ENST00000612795	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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