RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591303.2

PCSK4-211, Transcript of proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, human

TSL 3

Gene PCSK4, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCSK4-211	ENST00000591303	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PCSK4-211	ENST00000591303	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PCSK4-211	ENST00000591303	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PCSK4-211	ENST00000591303	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCSK4-211	ENST00000591303	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PCSK4-211	ENST00000591303	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PCSK4-211	ENST00000591303	ATP10A	O60312	1499 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PCSK4-211	ENST00000591303	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PCSK4-211	ENST00000591303	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PCSK4-211	ENST00000591303	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	PLCH2	O75038	1416 aa		33	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	PTPRT	O14522	1441 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCSK4-211	ENST00000591303	C3	P01024	1663 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PCSK4-211	ENST00000591303	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PCSK4-211	ENST00000591303	KDM5C	P41229	1560 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PCSK4-211	ENST00000591303	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PCSK4-211	ENST00000591303	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PCSK4-211	ENST00000591303	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PCSK4-211	ENST00000591303	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PCSK4-211	ENST00000591303	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PCSK4-211	ENST00000591303	KIF14	Q15058	1648 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCSK4-211	ENST00000591303	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCSK4-211	ENST00000591303	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCSK4-211	ENST00000591303	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCSK4-211	ENST00000591303	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PCSK4-211	ENST00000591303	AGL	P35573	1532 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PCSK4-211	ENST00000591303	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PCSK4-211	ENST00000591303	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCSK4-211	ENST00000591303	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PCSK4-211	ENST00000591303	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PCSK4-211	ENST00000591303	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PCSK4-211	ENST00000591303	EEA1	Q15075	1411 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PCSK4-211	ENST00000591303	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	ABCC1	P33527	1531 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PCSK4-211	ENST00000591303	NPAT	Q14207	1427 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PCSK4-211	ENST00000591303	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PCSK4-211	ENST00000591303	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PCSK4-211	ENST00000591303	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PCSK4-211	ENST00000591303	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCSK4-211	ENST00000591303	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	CLIP1	P30622	1438 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PCSK4-211	ENST00000591303	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PCSK4-211	ENST00000591303	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCSK4-211	ENST00000591303	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCSK4-211	ENST00000591303	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PCSK4-211	ENST00000591303	PKD2	Q13563	968 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PCSK4-211	ENST00000591303	HSPA1L	P34931	641 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCSK4-211	ENST00000591303	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PCSK4-211	ENST00000591303	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCSK4-211	ENST00000591303	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCSK4-211	ENST00000591303	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PCSK4-211	ENST00000591303	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PCSK4-211	ENST00000591303	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PCSK4-211	ENST00000591303	A2M	P01023	1474 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	CPS1	P31327	1500 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	TOM1	O60784	492 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	GGT6	Q6P531	493 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PCSK4-211	ENST00000591303	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PCSK4-211	ENST00000591303	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PCSK4-211	ENST00000591303	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32	■■■□□ 2.71
PCSK4-211	ENST00000591303	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PCSK4-211	ENST00000591303	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PCSK4-211	ENST00000591303	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7

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