RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-208ENST00000590509 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-208ENST00000590509 PLCH2O75038 1416 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-208ENST00000590509 STRCQ7RTU9 1775 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRS-208ENST00000590509 ATP10AO60312 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
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PTPRS-208ENST00000590509 ILDR2Q71H61 639 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRS-208ENST00000590509 KIF14Q15058 1648 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRS-208ENST00000590509 EEA1Q15075 1411 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRS-208ENST00000590509 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.01■■□□□ 1.91
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PTPRS-208ENST00000590509 AFAP1Q8N556 730 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRS-208ENST00000590509 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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PTPRS-208ENST00000590509 KDM5CP41229 1560 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRS-208ENST00000590509 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
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PTPRS-208ENST00000590509 C3P01024 1663 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRS-208ENST00000590509 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRS-208ENST00000590509 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.85■■□□□ 1.89
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PTPRS-208ENST00000590509 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.79■■□□□ 1.88
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PTPRS-208ENST00000590509 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRS-208ENST00000590509 PTPRTO14522 1441 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 SOCS7O14512 581 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 ABCC1P33527 1531 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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PTPRS-208ENST00000590509 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 AGLP35573 1532 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 PREX2Q70Z35 1606 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRS-208ENST00000590509 CLIP1P30622 1438 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRS-208ENST00000590509 NCOA1Q15788 1441 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRS-208ENST00000590509 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRS-208ENST00000590509 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.61■■□□□ 1.85
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PTPRS-208ENST00000590509 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRS-208ENST00000590509 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.53■■□□□ 1.84
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PTPRS-208ENST00000590509 NPATQ14207 1427 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRS-208ENST00000590509 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRS-208ENST00000590509 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 PLXNC1O60486 1568 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 PTPRKQ15262 1439 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 ATP7AQ04656 1500 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 A2MP01023 1474 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRS-208ENST00000590509 PLA2R1Q13018 1463 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRS-208ENST00000590509 GGT6Q6P531 493 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRS-208ENST00000590509 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRS-208ENST00000590509 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRS-208ENST00000590509 PKD2Q13563 968 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRS-208ENST00000590509 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRS-208ENST00000590509 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRS-208ENST00000590509 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRS-208ENST00000590509 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 HSPA1LP34931 641 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 MBD5Q9P267 1494 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 TIAM1Q13009 1591 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
PTPRS-208ENST00000590509 PIP4K2BP78356 416 aa26.2■■□□□ 1.78
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