RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586016.5

SLC25A39-207, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,156 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-207ENST00000586016 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC25A39-207ENST00000586016 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC25A39-207ENST00000586016 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SLC25A39-207ENST00000586016 KIF14Q15058 1648 aa25.55■■□□□ 1.68
SLC25A39-207ENST00000586016 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SLC25A39-207ENST00000586016 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.53■■□□□ 1.68
SLC25A39-207ENST00000586016 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SLC25A39-207ENST00000586016 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.51■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 CLIP1P30622 1438 aa25.5■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.49■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.48■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 ATP10AO60312 1499 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 FBXO41Q8TF61 875 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 MLECQ14165 292 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC25A39-207ENST00000586016 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC25A39-207ENST00000586016 KDM5CP41229 1560 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC25A39-207ENST00000586016 HSPA2P54652 639 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC25A39-207ENST00000586016 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.39■■□□□ 1.65
SLC25A39-207ENST00000586016 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC25A39-207ENST00000586016 PREX2Q70Z35 1606 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC25A39-207ENST00000586016 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.35■■□□□ 1.65
SLC25A39-207ENST00000586016 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.35■■□□□ 1.65
SLC25A39-207ENST00000586016 AFAP1Q8N556 730 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A39-207ENST00000586016 ABCC1P33527 1531 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 REREQ9P2R6 1566 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 ABCA6Q8N139 1617 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A39-207ENST00000586016 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-207ENST00000586016 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-207ENST00000586016 AGLP35573 1532 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-207ENST00000586016 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-207ENST00000586016 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A39-207ENST00000586016 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC25A39-207ENST00000586016 C3P01024 1663 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC25A39-207ENST00000586016 CERKQ8TCT0 537 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-207ENST00000586016 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC25A39-207ENST00000586016 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 STRCQ7RTU9 1775 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC25A39-207ENST00000586016 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 ATP7AQ04656 1500 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 MROH2AA6NES4 1674 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.62e-7■■■□□ 14.8
SLC25A39-207ENST00000586016 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC25A39-207ENST00000586016 PTPRTO14522 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 PLXNC1O60486 1568 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 NPATQ14207 1427 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.97■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 A2MP01023 1474 aa24.97■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 NCOA1Q15788 1441 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 TIAM1Q13009 1591 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC25A39-207ENST00000586016 ZMYM3Q14202 1370 aa24.94■■□□□ 1.58
SLC25A39-207ENST00000586016 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SLC25A39-207ENST00000586016 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC25A39-207ENST00000586016 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC25A39-207ENST00000586016 CEP162Q5TB80 1403 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC25A39-207ENST00000586016 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 MBD5Q9P267 1494 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 PTPRKQ15262 1439 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 GGT6Q6P531 493 aa24.84■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.83■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SLC25A39-207ENST00000586016 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.83■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 PLA2R1Q13018 1463 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 NCOA2Q15596 1464 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-207ENST00000586016 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-207ENST00000586016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-207ENST00000586016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-207ENST00000586016 PKD2Q13563 968 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-207ENST00000586016 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-207ENST00000586016 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-207ENST00000586016 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SLC25A39-207ENST00000586016 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-207ENST00000586016 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.69■■□□□ 1.54
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