RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-215ENST00000583289 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRM-215ENST00000583289 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRM-215ENST00000583289 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRM-215ENST00000583289 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-215ENST00000583289 KIF3CO14782 793 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R37O75864 691 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-215ENST00000583289 C2orf72A6NCS6 295 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-215ENST00000583289 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-215ENST00000583289 TMC2Q8TDI7 906 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-215ENST00000583289 FAM205CA6NFA0 338 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-215ENST00000583289 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-215ENST00000583289 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-215ENST00000583289 GPR153Q6NV75 609 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 ERBB3P21860 1342 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 SLC34A2O95436 690 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 POTEB3A0JP26 581 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 POTEBQ6S5H4 581 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 ARSIQ5FYB1 569 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-215ENST00000583289 FOXK1P85037 733 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 PLPP6Q8IY26 295 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 DSG2Q14126 1118 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 NUDT7P0C024 238 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 PDE4AP27815 886 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 TBC1D12O60347 775 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-215ENST00000583289 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 MMRN1Q13201 1228 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 LHX6Q9UPM6 363 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 PBX2P40425 430 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 OXER1Q8TDS5 423 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-215ENST00000583289 MFSD10Q14728 455 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 PTGER2P43116 358 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP33O14559 1287 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 MAP3K9P80192 1104 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 KCNH8Q96L42 1107 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 EVI5O60447 810 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-215ENST00000583289 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 JPH4Q96JJ6 628 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 FOSBP53539 338 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 CAMK2BQ13554 666 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 CFAP44Q96MT7 982 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 TK2O00142 265 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 PSEN2P49810 448 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 KCNK17Q96T54 332 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRM-215ENST00000583289 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 PTPREP23469 700 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 DPYSL4O14531 572 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 HRO43593 1189 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 FBXW7Q969H0 707 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 STAC3Q96MF2 364 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-215ENST00000583289 PHF14O94880 888 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 WDR70Q9NW82 654 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 E2F4Q16254 413 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 EPAS1Q99814 870 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 PDIA6Q15084 440 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-215ENST00000583289 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.1 ms