RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
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GGA3-205ENST00000578348 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GGA3-205ENST00000578348 ABCC5O15440 1437 aa16.31■□□□□ 0.2
GGA3-205ENST00000578348 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.31■□□□□ 0.2
GGA3-205ENST00000578348 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.31■□□□□ 0.2
GGA3-205ENST00000578348 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.3■□□□□ 0.2
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GGA3-205ENST00000578348 KDM6BO15054 1643 aa16.28■□□□□ 0.2
GGA3-205ENST00000578348 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.28■□□□□ 0.2
GGA3-205ENST00000578348 KCNH8Q96L42 1107 aa16.28■□□□□ 0.2
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GGA3-205ENST00000578348 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.26■□□□□ 0.19
GGA3-205ENST00000578348 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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GGA3-205ENST00000578348 ABCC2Q92887 1545 aa16.21■□□□□ 0.19
GGA3-205ENST00000578348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.21■□□□□ 0.18
GGA3-205ENST00000578348 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
GGA3-205ENST00000578348 TRIM52Q96A61 297 aa16.19■□□□□ 0.18
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GGA3-205ENST00000578348 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
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GGA3-205ENST00000578348 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.16■□□□□ 0.18
GGA3-205ENST00000578348 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
GGA3-205ENST00000578348 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.16■□□□□ 0.18
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GGA3-205ENST00000578348 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.83■□□□□ 0.12
GGA3-205ENST00000578348 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.82■□□□□ 0.12
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GGA3-205ENST00000578348 ASXL2Q76L83 1435 aa15.81■□□□□ 0.12
GGA3-205ENST00000578348 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
GGA3-205ENST00000578348 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.8■□□□□ 0.12
GGA3-205ENST00000578348 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.8■□□□□ 0.12
GGA3-205ENST00000578348 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.8■□□□□ 0.12
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