RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP6P59044 892 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 ARSIQ5FYB1 569 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-204ENST00000577468 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 PBX2P40425 430 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 KIF3CO14782 793 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 SLC34A2O95436 690 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 STK24Q9Y6E0 443 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf72A6NCS6 295 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 MFRPQ9BY79 579 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT7P0C024 238 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 LHX6Q9UPM6 363 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 STK25O00506 426 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 TMC2Q8TDI7 906 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 HCSTQ9UBK5 93 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-204ENST00000577468 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP33O14559 1287 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 TK2O00142 265 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-204ENST00000577468 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 HRO43593 1189 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R37O75864 691 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 RGL2O15211 777 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D12O60347 775 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 FOXK1P85037 733 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 STAC3Q96MF2 364 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 KCNH8Q96L42 1107 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-204ENST00000577468 PSEN2P49810 448 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 PKD2Q13563 968 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 PLPP6Q8IY26 295 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 RGS20O76081 388 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 DSG2Q14126 1118 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK17Q96T54 332 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 IFFO2Q5TF58 517 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 OXER1Q8TDS5 423 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN5P54829 565 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-204ENST00000577468 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 PTPREP23469 700 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 FOSBP53539 338 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JS52 829 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 WNT2BQ93097 391 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 JPH4Q96JJ6 628 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF3Q9H094 633 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-204ENST00000577468 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 PDE4AP27815 886 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 EVI5O60447 810 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-204ENST00000577468 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K9P80192 1104 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 FBXW7Q969H0 707 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD10Q14728 455 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.85□□□□□ -1.31
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