RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577246.5

COPS3-214, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 639 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-214ENST00000577246 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
COPS3-214ENST00000577246 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 FMN1Q68DA7 1419 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 ATP10AO60312 1499 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.24■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 CERKQ8TCT0 537 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COPS3-214ENST00000577246 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.19■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.17■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.16■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 CLIP1P30622 1438 aa22.15■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 KIF14Q15058 1648 aa22.15■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.14■■□□□ 1.14
COPS3-214ENST00000577246 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.11■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 KDM5CP41229 1560 aa22.1■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 AFAP1Q8N556 730 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS3-214ENST00000577246 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COPS3-214ENST00000577246 REREQ9P2R6 1566 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS3-214ENST00000577246 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS3-214ENST00000577246 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
COPS3-214ENST00000577246 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.03■■□□□ 1.12
COPS3-214ENST00000577246 AGLP35573 1532 aa22■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 PTPRTO14522 1441 aa21.98■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.98■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.97■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 STRCQ7RTU9 1775 aa21.96■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.96■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 ABCC1P33527 1531 aa21.96■■□□□ 1.11
COPS3-214ENST00000577246 ABCA6Q8N139 1617 aa21.95■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.95■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 PREX2Q70Z35 1606 aa21.95■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.92■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.92■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 C3P01024 1663 aa21.91■■□□□ 1.1
COPS3-214ENST00000577246 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.88■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.88■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.88■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 NPATQ14207 1427 aa21.87■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 NCOA1Q15788 1441 aa21.87■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.84■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 SOCS7O14512 581 aa21.83■■□□□ 1.09
COPS3-214ENST00000577246 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.83■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.81■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 MROH2AA6NES4 1674 aa21.8■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 ZMYM3Q14202 1370 aa21.8■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.8■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 ILDR2Q71H61 639 aa21.8■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.79■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.78■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.78■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.78■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.77■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.77■■□□□ 1.08
COPS3-214ENST00000577246 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 PKD2Q13563 968 aa21.74■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 ATP7AQ04656 1500 aa21.74■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 A2MP01023 1474 aa21.72■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 PLA2R1Q13018 1463 aa21.72■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.72■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.72■■□□□ 1.07
COPS3-214ENST00000577246 PLXNC1O60486 1568 aa21.7■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.7■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.67■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 PTPRKQ15262 1439 aa21.67■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 GGT6Q6P531 493 aa21.67■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.66■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.66■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
COPS3-214ENST00000577246 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS3-214ENST00000577246 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS3-214ENST00000577246 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS3-214ENST00000577246 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
COPS3-214ENST00000577246 MBD5Q9P267 1494 aa21.54■■□□□ 1.04
COPS3-214ENST00000577246 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.54■■□□□ 1.04
COPS3-214ENST00000577246 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.54■■□□□ 1.04
COPS3-214ENST00000577246 TIAM1Q13009 1591 aa21.53■■□□□ 1.04
COPS3-214ENST00000577246 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
COPS3-214ENST00000577246 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
COPS3-214ENST00000577246 TNRQ92752 1358 aa21.51■■□□□ 1.03
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