RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572085.5

TP53BP1-216, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TP53BP1, Length 5,574 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1-216ENST00000572085 ATF3P18847 181 aa12.92□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 TMF1P82094 1093 aa12.91□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 MORC1Q86VD1 984 aa12.91□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 AMPHP49418 695 aa12.91□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TP53BP1-216ENST00000572085 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa12.89□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 VPS53Q5VIR6 699 aa12.89□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 KIF3BO15066 747 aa12.89□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 BECN1Q14457 450 aa12.89□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.88□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.87□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 NRDCO43847 1150 aa12.87□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.87□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.86□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.85□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.85□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 MARCH6O60337 910 aa12.85□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 STK31Q9BXU1 1019 aa12.85□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.84□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 AMOTL1Q8IY63 956 aa12.84□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.84□□□□□ -0.35
TP53BP1-216ENST00000572085 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.83□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 MCCP23508 829 aa12.83□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 FBXW7Q969H0 707 aa12.83□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 NUTM2FA1L443 756 aa12.82□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.82□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa12.81□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 PSME1Q06323 249 aa12.8□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 NACADO15069 1562 aa12.79□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.79□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 GPATCH3Q96I76 525 aa12.79□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.78□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 TOMM22Q9NS69 142 aa12.78□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 CFAP44Q96MT7 982 aa12.78□□□□□ -0.36
TP53BP1-216ENST00000572085 RAD21O60216 631 aa12.77□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.77□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 PIP4K2BP78356 416 aa12.76□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 CEP89Q96ST8 783 aa12.75□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 VPS37DQ86XT2 251 aa12.74□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.74□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 EEA1Q15075 1411 aa12.73□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.73□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.72□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 22.7
TP53BP1-216ENST00000572085 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.71□□□□□ -0.37
TP53BP1-216ENST00000572085 CUX2O14529 1486 aa12.71□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 PLCB2Q00722 1185 aa12.7□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 TEFQ10587 303 aa12.7□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 JPH4Q96JJ6 628 aa12.7□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.69□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 SOGA1O94964 1423 aa12.68□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.68□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 NBR1Q14596 966 aa12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 GOLGA3Q08378 1498 aa12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 APBB1O00213 710 aa12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.67□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.66□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.66□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 COG3Q96JB2 828 aa12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 PKD2Q13563 968 aa12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 HMMRO75330 724 aa12.65□□□□□ -0.38
TP53BP1-216ENST00000572085 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms