RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.78■■■□□ 2.52
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC5O15440 1437 aa30.76■■■□□ 2.52
SPNS1-212ENST00000568900 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.76■■■□□ 2.52
SPNS1-212ENST00000568900 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.75■■■□□ 2.51
SPNS1-212ENST00000568900 AKNAQ7Z591 1439 aa30.73■■■□□ 2.51
SPNS1-212ENST00000568900 MAPKBP1O60336 1514 aa30.71■■■□□ 2.51
SPNS1-212ENST00000568900 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.7■■■□□ 2.5
SPNS1-212ENST00000568900 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.53e-6■■□□□ 13.1
SPNS1-212ENST00000568900 PREX2Q70Z35 1606 aa30.68■■■□□ 2.5
SPNS1-212ENST00000568900 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.67■■■□□ 2.5
SPNS1-212ENST00000568900 KCNH8Q96L42 1107 aa30.66■■■□□ 2.5
SPNS1-212ENST00000568900 ROCK1Q13464 1354 aa30.65■■■□□ 2.5
SPNS1-212ENST00000568900 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.64■■■□□ 2.5
SPNS1-212ENST00000568900 KDM6BO15054 1643 aa30.62■■■□□ 2.49
SPNS1-212ENST00000568900 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.61■■■□□ 2.49
SPNS1-212ENST00000568900 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.6■■■□□ 2.49
SPNS1-212ENST00000568900 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.58■■■□□ 2.49
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.57■■■□□ 2.48
SPNS1-212ENST00000568900 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
SPNS1-212ENST00000568900 ADGRL2O95490 1459 aa30.52■■■□□ 2.48
SPNS1-212ENST00000568900 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.52■■■□□ 2.48
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.51■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 NCOA1Q15788 1441 aa30.51■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.49■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 MBD5Q9P267 1494 aa30.49■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM52Q96A61 297 aa30.48■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.47■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.46■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.46■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 PLCH2O75038 1416 aa30.46■■■□□ 2.47
SPNS1-212ENST00000568900 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.45■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 TSPY4P0CV99 314 aa30.44■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 TSPY10P0CW01 314 aa30.44■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.44■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 ASXL2Q76L83 1435 aa30.43■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 NEUROD1Q13562 356 aa30.42■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.39■■■□□ 2.46
SPNS1-212ENST00000568900 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.38■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.37■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.36■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.35■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.34■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.33■■■□□ 2.45
SPNS1-212ENST00000568900 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.32■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.32■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC1P33527 1531 aa30.3■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 KIF15Q9NS87 1388 aa30.3■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.28■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.28■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.28■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.28■■■□□ 2.44
SPNS1-212ENST00000568900 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS1-212ENST00000568900 FANCAO15360 1455 aa30.22■■■□□ 2.43
SPNS1-212ENST00000568900 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.22■■■□□ 2.43
SPNS1-212ENST00000568900 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
SPNS1-212ENST00000568900 PZPP20742 1482 aa30.21■■■□□ 2.43
SPNS1-212ENST00000568900 FOXD1Q16676 465 aa30.21■■■□□ 2.43
SPNS1-212ENST00000568900 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.19■■■□□ 2.42
SPNS1-212ENST00000568900 TONSLQ96HA7 1378 aa30.19■■■□□ 2.42
SPNS1-212ENST00000568900 PLXNC1O60486 1568 aa30.18■■■□□ 2.42
SPNS1-212ENST00000568900 NUP155O75694 1391 aa30.12■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.1■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 ADGRL1O94910 1474 aa30.1■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 AFAP1Q8N556 730 aa30.1■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 CD109Q6YHK3 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.08■■■□□ 2.41
SPNS1-212ENST00000568900 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SPNS1-212ENST00000568900 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.07■■■□□ 2.4
SPNS1-212ENST00000568900 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.06■■■□□ 2.4
SPNS1-212ENST00000568900 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.04■■■□□ 2.4
SPNS1-212ENST00000568900 PKD2Q13563 968 aa30.04■■■□□ 2.4
SPNS1-212ENST00000568900 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.02■■■□□ 2.4
SPNS1-212ENST00000568900 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.01■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 UNC13BO14795 1591 aa30■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 ERBINQ96RT1 1412 aa29.99■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 ATP7AQ04656 1500 aa29.97■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.96■■■□□ 2.39
SPNS1-212ENST00000568900 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
SPNS1-212ENST00000568900 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.92■■■□□ 2.38
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.9■■■□□ 2.38
SPNS1-212ENST00000568900 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.89■■■□□ 2.38
SPNS1-212ENST00000568900 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.89■■■□□ 2.38
SPNS1-212ENST00000568900 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.88■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.87■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 GLI2P10070 1586 aa29.86■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 NEO1Q92859 1461 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-212ENST00000568900 KDM5CP41229 1560 aa29.81■■■□□ 2.36
SPNS1-212ENST00000568900 DIP2BQ9P265 1576 aa29.81■■■□□ 2.36
SPNS1-212ENST00000568900 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.78■■■□□ 2.36
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