RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.89■■□□□ 1.89
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CS-227ENST00000551441 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-227ENST00000551441 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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CS-227ENST00000551441 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.83■■□□□ 1.89
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CS-227ENST00000551441 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.77■■□□□ 1.88
CS-227ENST00000551441 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CS-227ENST00000551441 KIF14Q15058 1648 aa26.76■■□□□ 1.87
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CS-227ENST00000551441 ATP10AO60312 1499 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-227ENST00000551441 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.73■■□□□ 1.87
CS-227ENST00000551441 AFAP1Q8N556 730 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-227ENST00000551441 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-227ENST00000551441 FMN1Q68DA7 1419 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-227ENST00000551441 CERKQ8TCT0 537 aa26.69■■□□□ 1.86
CS-227ENST00000551441 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.69■■□□□ 1.86
CS-227ENST00000551441 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CS-227ENST00000551441 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.68■■□□□ 1.86
CS-227ENST00000551441 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.68■■□□□ 1.86
CS-227ENST00000551441 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
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CS-227ENST00000551441 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.61■■□□□ 1.85
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CS-227ENST00000551441 CLIP1P30622 1438 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-227ENST00000551441 KDM5CP41229 1560 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-227ENST00000551441 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-227ENST00000551441 ABCA6Q8N139 1617 aa26.54■■□□□ 1.84
CS-227ENST00000551441 STRCQ7RTU9 1775 aa26.54■■□□□ 1.84
CS-227ENST00000551441 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.52■■□□□ 1.84
CS-227ENST00000551441 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-227ENST00000551441 C3P01024 1663 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-227ENST00000551441 PREX2Q70Z35 1606 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-227ENST00000551441 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.47■■□□□ 1.83
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CS-227ENST00000551441 ABCC1P33527 1531 aa26.45■■□□□ 1.83
CS-227ENST00000551441 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.45■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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CS-227ENST00000551441 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.42■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 REREQ9P2R6 1566 aa26.42■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.42■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.39■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CS-227ENST00000551441 AGLP35573 1532 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-227ENST00000551441 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.34■■□□□ 1.81
CS-227ENST00000551441 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
CS-227ENST00000551441 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.33■■□□□ 1.8
CS-227ENST00000551441 ILDR2Q71H61 639 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-227ENST00000551441 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CS-227ENST00000551441 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-227ENST00000551441 PTPRTO14522 1441 aa26.31■■□□□ 1.8
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CS-227ENST00000551441 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.25■■□□□ 1.79
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CS-227ENST00000551441 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.24■■□□□ 1.79
CS-227ENST00000551441 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.24■■□□□ 1.79
CS-227ENST00000551441 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.24■■□□□ 1.79
CS-227ENST00000551441 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CS-227ENST00000551441 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CS-227ENST00000551441 GGT6Q6P531 493 aa26.2■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 ATP7AQ04656 1500 aa26.19■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 MROH2AA6NES4 1674 aa26.19■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.17■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 NPATQ14207 1427 aa26.15■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 A2MP01023 1474 aa26.15■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CS-227ENST00000551441 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.13■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.12■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.12■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 PLXNC1O60486 1568 aa26.12■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.11■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 PTPRKQ15262 1439 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 SOCS7O14512 581 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-227ENST00000551441 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.07■■□□□ 1.76
CS-227ENST00000551441 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CS-227ENST00000551441 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CS-227ENST00000551441 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
CS-227ENST00000551441 TIAM1Q13009 1591 aa26.04■■□□□ 1.76
CS-227ENST00000551441 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.03■■□□□ 1.76
CS-227ENST00000551441 PKD2Q13563 968 aa26.01■■□□□ 1.75
CS-227ENST00000551441 PLA2R1Q13018 1463 aa25.98■■□□□ 1.75
CS-227ENST00000551441 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CS-227ENST00000551441 MBD5Q9P267 1494 aa25.98■■□□□ 1.75
CS-227ENST00000551441 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CS-227ENST00000551441 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.98■■□□□ 1.75
CS-227ENST00000551441 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.95■■□□□ 1.74
CS-227ENST00000551441 KIF3BO15066 747 aa25.94■■□□□ 1.74
CS-227ENST00000551441 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CS-227ENST00000551441 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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