RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 KDM6BO15054 1643 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 ITGAEP38570 1179 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 AKNAQ7Z591 1439 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-203ENST00000546585 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 ABCC5O15440 1437 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 DAPK1P53355 1430 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 PREX2Q70Z35 1606 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 ROCK1Q13464 1354 aa10.27□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.76
CS-203ENST00000546585 ADGRL2O95490 1459 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 MBD5Q9P267 1494 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 NCOA1Q15788 1441 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 ASXL2Q76L83 1435 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
CS-203ENST00000546585 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.21□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 PZPP20742 1482 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 PLCH2O75038 1416 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 KCNH8Q96L42 1107 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 GLI2P10070 1586 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 ABCC1P33527 1531 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-203ENST00000546585 PLXNC1O60486 1568 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 DIP2BQ9P265 1576 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 FOXD1Q16676 465 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 FANCAO15360 1455 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 UNC13BO14795 1591 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 CD109Q6YHK3 1445 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-203ENST00000546585 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 TSPOAP1O95153 1857 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 KIF15Q9NS87 1388 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 ADRA2BP18089 450 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 NEO1Q92859 1461 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 NEUROD1Q13562 356 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 ADGRL1O94910 1474 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 TSPY4P0CV99 314 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 TSPY10P0CW01 314 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 RICTORQ6R327 1708 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 TRIM52Q96A61 297 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 KDM5CP41229 1560 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 DEPDC5O75140 1603 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms