RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545588.5

ZBED6-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 7,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-201ENST00000545588 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ZBED6-201ENST00000545588 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.59□□□□□ -1.35
ZBED6-201ENST00000545588 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ZBED6-201ENST00000545588 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ZBED6-201ENST00000545588 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.59□□□□□ -1.35
ZBED6-201ENST00000545588 HSCBQ8IWL3 235 aa6.59□□□□□ -1.35
ZBED6-201ENST00000545588 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.59□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.58□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 MORC1Q86VD1 984 aa6.58□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.58□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 PTMSP20962 102 aa6.57□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 ABCC8Q09428 1581 aa6.57□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.57□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 GPATCH3Q96I76 525 aa6.57□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 MLECQ14165 292 aa6.56□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.56□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 RGS3P49796 1198 aa6.56□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 PLCB2Q00722 1185 aa6.56□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 EID1Q9Y6B2 187 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 SMARCA4P51532 1647 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 SOGA1O94964 1423 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 CLSTN1O94985 981 aa6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 GGT6Q6P531 493 aa6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 SOX12O15370 315 aa6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.54□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 UACAQ9BZF9 1416 aa6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 RALBP1Q15311 655 aa6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 DRC7Q8IY82 874 aa6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 STK26Q9P289 416 aa6.52□□□□□ -1.36
ZBED6-201ENST00000545588 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.52□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CCER2I3L3R5 266 aa6.52□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.52□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.52□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 STK31Q9BXU1 1019 aa6.52□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 NUP155O75694 1391 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.374e-7■■■□□ 18.2
ZBED6-201ENST00000545588 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 GORABQ5T7V8 394 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 GBP4Q96PP9 640 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 HMMRO75330 724 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.51□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 TPM4P67936 248 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 PKD2Q13563 968 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 G3V3G9 751 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 USP35Q9P2H5 1018 aa6.49□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 KIF3AQ9Y496 699 aa6.49□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.48□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.48□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.48□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.48□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 PHF14O94880 888 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 AMPHP49418 695 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 CUX1P39880 1505 aa6.47□□□□□ -1.37
ZBED6-201ENST00000545588 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.46□□□□□ -1.38
ZBED6-201ENST00000545588 KIF3BO15066 747 aa6.46□□□□□ -1.38
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.46□□□□□ -1.38
ZBED6-201ENST00000545588 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ZBED6-201ENST00000545588 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.45□□□□□ -1.38
ZBED6-201ENST00000545588 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms