RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537248.5

ZNF384-208, Transcript of zinc finger protein 384, human

TSL 2

Gene ZNF384, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF384-208	ENST00000537248	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		30.73	■■■□□ 2.51
ZNF384-208	ENST00000537248	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	30.71	■■■□□ 2.51
ZNF384-208	ENST00000537248	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		30.7	■■■□□ 2.5
ZNF384-208	ENST00000537248	PLCH2	O75038	1416 aa		30.68	■■■□□ 2.5
ZNF384-208	ENST00000537248	ATP10A	O60312	1499 aa		30.66	■■■□□ 2.5
ZNF384-208	ENST00000537248	STRC	Q7RTU9	1775 aa		30.66	■■■□□ 2.5
ZNF384-208	ENST00000537248	EEA1	Q15075	1411 aa		30.64	■■■□□ 2.5
ZNF384-208	ENST00000537248	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30.64	■■■□□ 2.5
ZNF384-208	ENST00000537248	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		30.64	■■■□□ 2.49
ZNF384-208	ENST00000537248	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	30.57	■■■□□ 2.48
ZNF384-208	ENST00000537248	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	30.56	■■■□□ 2.48
ZNF384-208	ENST00000537248	ILDR2	Q71H61	639 aa		30.52	■■■□□ 2.48
ZNF384-208	ENST00000537248	KIF14	Q15058	1648 aa		30.51	■■■□□ 2.48
ZNF384-208	ENST00000537248	KDM5C	P41229	1560 aa		30.51	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		30.51	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		30.5	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.5	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		30.49	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		30.47	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		30.46	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	C3	P01024	1663 aa		30.46	■■■□□ 2.47
ZNF384-208	ENST00000537248	RERE	Q9P2R6	1566 aa		30.44	■■■□□ 2.46
ZNF384-208	ENST00000537248	SOCS7	O14512	581 aa		30.42	■■■□□ 2.46
ZNF384-208	ENST00000537248	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		30.42	■■■□□ 2.46
ZNF384-208	ENST00000537248	FMN1	Q68DA7	1419 aa		30.41	■■■□□ 2.46
ZNF384-208	ENST00000537248	AFAP1	Q8N556	730 aa		30.41	■■■□□ 2.46
ZNF384-208	ENST00000537248	ABCA6	Q8N139	1617 aa		30.4	■■■□□ 2.46
ZNF384-208	ENST00000537248	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		30.39	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		30.39	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	30.38	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	PTPRT	O14522	1441 aa		30.38	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	30.37	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		30.37	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	30.36	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		30.34	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		30.34	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		30.33	■■■□□ 2.45
ZNF384-208	ENST00000537248	AGL	P35573	1532 aa		30.32	■■■□□ 2.44
ZNF384-208	ENST00000537248	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		30.29	■■■□□ 2.44
ZNF384-208	ENST00000537248	CLIP1	P30622	1438 aa		30.29	■■■□□ 2.44
ZNF384-208	ENST00000537248	PREX2	Q70Z35	1606 aa		30.28	■■■□□ 2.44
ZNF384-208	ENST00000537248	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		30.27	■■■□□ 2.44
ZNF384-208	ENST00000537248	ABCC1	P33527	1531 aa		30.27	■■■□□ 2.44
ZNF384-208	ENST00000537248	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		30.26	■■■□□ 2.43
ZNF384-208	ENST00000537248	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ZNF384-208	ENST00000537248	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ZNF384-208	ENST00000537248	NCOA1	Q15788	1441 aa		30.23	■■■□□ 2.43
ZNF384-208	ENST00000537248	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	30.21	■■■□□ 2.43
ZNF384-208	ENST00000537248	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.19	■■■□□ 2.42
ZNF384-208	ENST00000537248	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	30.19	■■■□□ 2.42
ZNF384-208	ENST00000537248	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		30.18	■■■□□ 2.42
ZNF384-208	ENST00000537248	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.17	■■■□□ 2.42
ZNF384-208	ENST00000537248	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		30.16	■■■□□ 2.42
ZNF384-208	ENST00000537248	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		30.15	■■■□□ 2.42
ZNF384-208	ENST00000537248	NPAT	Q14207	1427 aa		30.11	■■■□□ 2.41
ZNF384-208	ENST00000537248	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		30.09	■■■□□ 2.41
ZNF384-208	ENST00000537248	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		30.06	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	ZMYM3	Q14202	1370 aa		30.03	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		30.03	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	30.02	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		30.02	■■■□□ 2.4
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
ZNF384-208	ENST00000537248	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		30	■■■□□ 2.39
ZNF384-208	ENST00000537248	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		30	■■■□□ 2.39
ZNF384-208	ENST00000537248	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ZNF384-208	ENST00000537248	PLXNC1	O60486	1568 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ZNF384-208	ENST00000537248	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
ZNF384-208	ENST00000537248	ATP7A	Q04656	1500 aa		29.95	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	PKD2	Q13563	968 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ZNF384-208	ENST00000537248	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ZNF384-208	ENST00000537248	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.88	■■■□□ 2.37
ZNF384-208	ENST00000537248	A2M	P01023	1474 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ZNF384-208	ENST00000537248	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ZNF384-208	ENST00000537248	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		29.82	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	GGT6	Q6P531	493 aa		29.78	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		29.78	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ZNF384-208	ENST00000537248	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
ZNF384-208	ENST00000537248	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
ZNF384-208	ENST00000537248	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ZNF384-208	ENST00000537248	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.7	■■■□□ 2.35
ZNF384-208	ENST00000537248	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.7	■■■□□ 2.35
ZNF384-208	ENST00000537248	HSPA1L	P34931	641 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ZNF384-208	ENST00000537248	CPS1	P31327	1500 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ZNF384-208	ENST00000537248	MBD5	Q9P267	1494 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ZNF384-208	ENST00000537248	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ZNF384-208	ENST00000537248	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.34
ZNF384-208	ENST00000537248	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.64	■■■□□ 2.33

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