RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, human

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GOLGA3-204	ENST00000534967	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43.89	■■■■■ 4.62
GOLGA3-204	ENST00000534967	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.86	■■■■■ 4.61
GOLGA3-204	ENST00000534967	HSPA2	P54652	639 aa		43.85	■■■■■ 4.61
GOLGA3-204	ENST00000534967	MLEC	Q14165	292 aa		43.85	■■■■■ 4.61
GOLGA3-204	ENST00000534967	FMN1	Q68DA7	1419 aa		43.82	■■■■■ 4.6
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.77	■■■■■ 4.6
GOLGA3-204	ENST00000534967	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.75	■■■■■ 4.59
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.75	■■■■■ 4.59
GOLGA3-204	ENST00000534967	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.74	■■■■■ 4.59
GOLGA3-204	ENST00000534967	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.72	■■■■■ 4.59
GOLGA3-204	ENST00000534967	ATP10A	O60312	1499 aa		43.7	■■■■■ 4.59
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIF14	Q15058	1648 aa		43.7	■■■■■ 4.59
GOLGA3-204	ENST00000534967	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.67	■■■■■ 4.58
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.64	■■■■■ 4.58
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.63	■■■■■ 4.57
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.59	■■■■■ 4.57
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.58	■■■■■ 4.57
GOLGA3-204	ENST00000534967	CLIP1	P30622	1438 aa		43.56	■■■■■ 4.56
GOLGA3-204	ENST00000534967	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.55	■■■■■ 4.56
GOLGA3-204	ENST00000534967	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.53	■■■■■ 4.56
GOLGA3-204	ENST00000534967	KDM5C	P41229	1560 aa		43.51	■■■■■ 4.56
GOLGA3-204	ENST00000534967	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.51	■■■■■ 4.56
GOLGA3-204	ENST00000534967	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.51	■■■■■ 4.56
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.47	■■■■■ 4.55
GOLGA3-204	ENST00000534967	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.46	■■■■■ 4.55
GOLGA3-204	ENST00000534967	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.44	■■■■■ 4.54
GOLGA3-204	ENST00000534967	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.42	■■■■■ 4.54
GOLGA3-204	ENST00000534967	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.42	■■■■■ 4.54
GOLGA3-204	ENST00000534967	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.35	■■■■■ 4.53
GOLGA3-204	ENST00000534967	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.33	■■■■■ 4.53
GOLGA3-204	ENST00000534967	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.33	■■■■■ 4.53
GOLGA3-204	ENST00000534967	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.33	■■■■■ 4.53
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GOLGA3-204	ENST00000534967	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GOLGA3-204	ENST00000534967	ABCC1	P33527	1531 aa		43.3	■■■■■ 4.52
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.3	■■■■■ 4.52
GOLGA3-204	ENST00000534967	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.28	■■■■■ 4.52
GOLGA3-204	ENST00000534967	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.25	■■■■■ 4.51
GOLGA3-204	ENST00000534967	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GOLGA3-204	ENST00000534967	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
GOLGA3-204	ENST00000534967	AGL	P35573	1532 aa		43.21	■■■■■ 4.51
GOLGA3-204	ENST00000534967	C3	P01024	1663 aa		43.2	■■■■■ 4.51
GOLGA3-204	ENST00000534967	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.19	■■■■■ 4.5
GOLGA3-204	ENST00000534967	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GOLGA3-204	ENST00000534967	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.15	■■■■■ 4.5
GOLGA3-204	ENST00000534967	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.1	■■■■■ 4.49
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
GOLGA3-204	ENST00000534967	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.04	■■■■■ 4.48
GOLGA3-204	ENST00000534967	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		43.01	■■■■■ 4.48
GOLGA3-204	ENST00000534967	PTPRT	O14522	1441 aa		43	■■■■■ 4.47
GOLGA3-204	ENST00000534967	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43	■■■■■ 4.47
GOLGA3-204	ENST00000534967	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
GOLGA3-204	ENST00000534967	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.95	■■■■■ 4.47	3e-12	■■■□□ 15.6
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
GOLGA3-204	ENST00000534967	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.88	■■■■■ 4.46
GOLGA3-204	ENST00000534967	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.85	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.84	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	NPAT	Q14207	1427 aa		42.84	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.84	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.82	■■■■■ 4.45
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.81	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.81	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.81	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	A2M	P01023	1474 aa		42.77	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.77	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GOLGA3-204	ENST00000534967	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
GOLGA3-204	ENST00000534967	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.74	■■■■■ 4.43
GOLGA3-204	ENST00000534967	GGT6	Q6P531	493 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GOLGA3-204	ENST00000534967	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.68	■■■■■ 4.42
GOLGA3-204	ENST00000534967	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.64	■■■■■ 4.42
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
GOLGA3-204	ENST00000534967	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.63	■■■■■ 4.42
GOLGA3-204	ENST00000534967	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.63	■■■■■ 4.41
GOLGA3-204	ENST00000534967	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.61	■■■■■ 4.41
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
GOLGA3-204	ENST00000534967	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.6	■■■■■ 4.41
GOLGA3-204	ENST00000534967	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
GOLGA3-204	ENST00000534967	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GOLGA3-204	ENST00000534967	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GOLGA3-204	ENST00000534967	PKD2	Q13563	968 aa		42.52	■■■■■ 4.4
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.52	■■■■■ 4.4
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.5	■■■■■ 4.39
GOLGA3-204	ENST00000534967	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
GOLGA3-204	ENST00000534967	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.47	■■■■■ 4.39
GOLGA3-204	ENST00000534967	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GOLGA3-204	ENST00000534967	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
GOLGA3-204	ENST00000534967	SOCS7	O14512	581 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GOLGA3-204	ENST00000534967	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.39	■■■■■ 4.38
GOLGA3-204	ENST00000534967	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.38	■■■■■ 4.37
GOLGA3-204	ENST00000534967	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIF3B	O15066	747 aa		42.34	■■■■■ 4.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms