RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	IFT140	Q96RY7	1462 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	P3H3	Q8IVL6	736 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	GRIN2A	Q12879	1464 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	ITGAE	P38570	1179 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	LAMC1	P11047	1609 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	PTPRG	P23470	1445 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	NUP160	Q12769	1436 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	UNC13B	O14795	1591 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	SHROOM2	Q13796	1616 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	PREX2	Q70Z35	1606 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	TONSL	Q96HA7	1378 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CTSC-208	ENST00000533897	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	SYNJ2	O15056	1496 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC184	Q52MB2	194 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	PLXNC1	O60486	1568 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	MSH5	O43196	834 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	FKBP8	Q14318	412 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	ANP32C	O43423	234 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	IQGAP1	P46940	1657 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	ATP10B	O94823	1461 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		6.21	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
CTSC-208	ENST00000533897	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	DEPDC5	O75140	1603 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	CHD1	O14646	1710 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	MYOM1	P52179	1685 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	ATP10A	O60312	1499 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM52	Q96A61	297 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	PLA2R1	Q13018	1463 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	CEP152	O94986	1710 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	IFT172	Q9UG01	1749 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	6.18	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	6.18	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	FOXD1	Q16676	465 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	MADD	Q8WXG6	1647 aa		6.18	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.17	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		6.17	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		6.17	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	INSR	P06213	1382 aa		6.17	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	USP47	Q96K76	1375 aa		6.16	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
CTSC-208	ENST00000533897	A2M	P01023	1474 aa		6.15	□□□□□ -1.43

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