RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 MMRN1Q13201 1228 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRK-220ENST00000531466 PKD2Q13563 968 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRK-220ENST00000531466 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRK-220ENST00000531466 RGL2O15211 777 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRK-220ENST00000531466 RIMBP2O15034 1052 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRK-220ENST00000531466 MFRPQ9BY79 579 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRK-220ENST00000531466 ERBB3P21860 1342 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRK-220ENST00000531466 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRK-220ENST00000531466 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRK-220ENST00000531466 GPR153Q6NV75 609 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRK-220ENST00000531466 ARSIQ5FYB1 569 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRK-220ENST00000531466 C2orf72A6NCS6 295 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-220ENST00000531466 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-220ENST00000531466 KIF3CO14782 793 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-220ENST00000531466 PPP1R37O75864 691 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-220ENST00000531466 TMC2Q8TDI7 906 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-220ENST00000531466 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRK-220ENST00000531466 NUDT7P0C024 238 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRK-220ENST00000531466 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRK-220ENST00000531466 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRK-220ENST00000531466 SLC34A2O95436 690 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRK-220ENST00000531466 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRK-220ENST00000531466 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRK-220ENST00000531466 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRK-220ENST00000531466 LHX6Q9UPM6 363 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRK-220ENST00000531466 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
PTPRK-220ENST00000531466 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRK-220ENST00000531466 PLPP6Q8IY26 295 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRK-220ENST00000531466 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTPRK-220ENST00000531466 FOXK1P85037 733 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-220ENST00000531466 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-220ENST00000531466 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-220ENST00000531466 PBX2P40425 430 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRK-220ENST00000531466 DSG2Q14126 1118 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRK-220ENST00000531466 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRK-220ENST00000531466 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-220ENST00000531466 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-220ENST00000531466 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PTPRK-220ENST00000531466 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRK-220ENST00000531466 ARHGAP33O14559 1287 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 TBC1D12O60347 775 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 PSEN2P49810 448 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-220ENST00000531466 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-220ENST00000531466 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-220ENST00000531466 OXER1Q8TDS5 423 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-220ENST00000531466 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-220ENST00000531466 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-220ENST00000531466 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-220ENST00000531466 KCNK17Q96T54 332 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-220ENST00000531466 PDE4AP27815 886 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-220ENST00000531466 TK2O00142 265 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-220ENST00000531466 HRO43593 1189 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-220ENST00000531466 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-220ENST00000531466 KCNH8Q96L42 1107 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-220ENST00000531466 HCSTQ9UBK5 93 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-220ENST00000531466 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-220ENST00000531466 STAC3Q96MF2 364 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 EVI5O60447 810 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 FOSBP53539 338 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 MFSD10Q14728 455 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-220ENST00000531466 JPH4Q96JJ6 628 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-220ENST00000531466 MAP3K9P80192 1104 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-220ENST00000531466 PTPREP23469 700 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-220ENST00000531466 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-220ENST00000531466 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-220ENST00000531466 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-220ENST00000531466 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-220ENST00000531466 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-220ENST00000531466 PTPN5P54829 565 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-220ENST00000531466 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-220ENST00000531466 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-220ENST00000531466 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-220ENST00000531466 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-220ENST00000531466 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 WNT2BQ93097 391 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 NBPF3Q9H094 633 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 DPYSL4O14531 572 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 COL9A1P20849 921 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 PROX2Q3B8N5 592 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 PHF14O94880 888 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 CAMK2BQ13554 666 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-220ENST00000531466 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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