RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.99■■■□□ 2.71
RPS20-210ENST00000523936 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.97■■■□□ 2.71
RPS20-210ENST00000523936 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
RPS20-210ENST00000523936 KIF14Q15058 1648 aa31.93■■■□□ 2.7
RPS20-210ENST00000523936 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.91■■■□□ 2.7
RPS20-210ENST00000523936 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.9■■■□□ 2.7
RPS20-210ENST00000523936 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
RPS20-210ENST00000523936 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
RPS20-210ENST00000523936 ATP10AO60312 1499 aa31.89■■■□□ 2.7
RPS20-210ENST00000523936 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.88■■■□□ 2.69
RPS20-210ENST00000523936 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.85■■■□□ 2.69
RPS20-210ENST00000523936 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.85■■■□□ 2.69
RPS20-210ENST00000523936 MLECQ14165 292 aa31.84■■■□□ 2.69
RPS20-210ENST00000523936 HSPA2P54652 639 aa31.83■■■□□ 2.69
RPS20-210ENST00000523936 KDM5CP41229 1560 aa31.81■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.81■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.81■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.8■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.8■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 CLIP1P30622 1438 aa31.79■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.79■■■□□ 2.68
RPS20-210ENST00000523936 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.76■■■□□ 2.67
RPS20-210ENST00000523936 AFAP1Q8N556 730 aa31.71■■■□□ 2.67
RPS20-210ENST00000523936 REREQ9P2R6 1566 aa31.71■■■□□ 2.67
RPS20-210ENST00000523936 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.71■■■□□ 2.67
RPS20-210ENST00000523936 PREX2Q70Z35 1606 aa31.71■■■□□ 2.67
RPS20-210ENST00000523936 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.66■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 ABCA6Q8N139 1617 aa31.66■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.66■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.65■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 ABCC1P33527 1531 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS20-210ENST00000523936 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
RPS20-210ENST00000523936 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.62■■■□□ 2.65
RPS20-210ENST00000523936 STRCQ7RTU9 1775 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS20-210ENST00000523936 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS20-210ENST00000523936 AGLP35573 1532 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS20-210ENST00000523936 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS20-210ENST00000523936 CERKQ8TCT0 537 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS20-210ENST00000523936 C3P01024 1663 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS20-210ENST00000523936 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.56■■■□□ 2.64
RPS20-210ENST00000523936 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.53■■■□□ 2.64
RPS20-210ENST00000523936 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.52■■■□□ 2.64
RPS20-210ENST00000523936 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.45■■■□□ 2.63
RPS20-210ENST00000523936 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.44■■■□□ 2.62
RPS20-210ENST00000523936 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.4■■■□□ 2.62
RPS20-210ENST00000523936 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
RPS20-210ENST00000523936 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
RPS20-210ENST00000523936 MROH2AA6NES4 1674 aa31.38■■■□□ 2.61
RPS20-210ENST00000523936 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.38■■■□□ 2.61
RPS20-210ENST00000523936 PTPRTO14522 1441 aa31.35■■■□□ 2.61
RPS20-210ENST00000523936 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
RPS20-210ENST00000523936 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
RPS20-210ENST00000523936 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.31■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 ATP7AQ04656 1500 aa31.29■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.29■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 NPATQ14207 1427 aa31.28■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 PLXNC1O60486 1568 aa31.27■■■□□ 2.6
RPS20-210ENST00000523936 NCOA1Q15788 1441 aa31.25■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 ZMYM3Q14202 1370 aa31.22■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.22■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.22■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 A2MP01023 1474 aa31.21■■■□□ 2.59
RPS20-210ENST00000523936 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.19■■■□□ 2.58
RPS20-210ENST00000523936 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.19■■■□□ 2.58
RPS20-210ENST00000523936 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.18■■■□□ 2.58
RPS20-210ENST00000523936 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
RPS20-210ENST00000523936 TIAM1Q13009 1591 aa31.16■■■□□ 2.58
RPS20-210ENST00000523936 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.14■■■□□ 2.58
RPS20-210ENST00000523936 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.14■■■□□ 2.57
RPS20-210ENST00000523936 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.12■■■□□ 2.57
RPS20-210ENST00000523936 MBD5Q9P267 1494 aa31.09■■■□□ 2.57
RPS20-210ENST00000523936 PTPRKQ15262 1439 aa31.09■■■□□ 2.57
RPS20-210ENST00000523936 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.07■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 GGT6Q6P531 493 aa31.06■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 PLA2R1Q13018 1463 aa31.06■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.05■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 CEP162Q5TB80 1403 aa31.05■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.01■■■□□ 2.56
RPS20-210ENST00000523936 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
RPS20-210ENST00000523936 PKD2Q13563 968 aa30.99■■■□□ 2.55
RPS20-210ENST00000523936 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.99■■■□□ 2.55
RPS20-210ENST00000523936 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
RPS20-210ENST00000523936 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.92■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.92■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.91■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.91■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 NCOA2Q15596 1464 aa30.9■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 ILDR2Q71H61 639 aa30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms