RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-208ENST00000511276 STRCQ7RTU9 1775 aa22.74■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 10.1
FAM53C-208ENST00000511276 HECW1Q76N89 1606 aa22.73■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.72■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FAM53C-208ENST00000511276 ATP10AO60312 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53C-208ENST00000511276 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53C-208ENST00000511276 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 PTPRTO14522 1441 aa22.58■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 PLCH2O75038 1416 aa22.58■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.55■■□□□ 1.2
FAM53C-208ENST00000511276 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.55■■□□□ 1.2
FAM53C-208ENST00000511276 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.49■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 C3P01024 1663 aa22.49■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.48■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.46■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 KDM5CP41229 1560 aa22.44■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 AFAP1Q8N556 730 aa22.44■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.42■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 NCOA1Q15788 1441 aa22.42■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.42■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 REREQ9P2R6 1566 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 KIF14Q15058 1648 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 ABCA6Q8N139 1617 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 AGLP35573 1532 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.33■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 EEA1Q15075 1411 aa22.28■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.27■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 NPATQ14207 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 MROH2AA6NES4 1674 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 FMN1Q68DA7 1419 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 CLIP1P30622 1438 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 ABCC1P33527 1531 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 ZMYM3Q14202 1370 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 PKD2Q13563 968 aa22.2■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 PLA2R1Q13018 1463 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 PREX2Q70Z35 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 HSPA1LP34931 641 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 PIP4K2BP78356 416 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 PTPRKQ15262 1439 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.08■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 TOM1O60784 492 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 CPS1P31327 1500 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 GGT6Q6P531 493 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 PLXNC1O60486 1568 aa22■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 36.5
FAM53C-208ENST00000511276 ATP7AQ04656 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 A2MP01023 1474 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.97■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.95■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 ALKQ9UM73 1620 aa21.93■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.92■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.89■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-208ENST00000511276 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-208ENST00000511276 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-208ENST00000511276 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.9 ms