RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.88□□□□□ -0.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIMBP2O15034 1052 aa13.85□□□□□ -0.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MFRPQ9BY79 579 aa13.85□□□□□ -0.19
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRP6P59044 892 aa13.83□□□□□ -0.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK24Q9Y6E0 443 aa13.8□□□□□ -0.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.79□□□□□ -0.2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF3CO14782 793 aa13.78□□□□□ -0.2
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK25O00506 426 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGL2O15211 777 aa13.72□□□□□ -0.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.71□□□□□ -0.21
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf72A6NCS6 295 aa13.7□□□□□ -0.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R37O75864 691 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC34A2O95436 690 aa13.59□□□□□ -0.23
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDT7P0C024 238 aa13.58□□□□□ -0.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.56□□□□□ -0.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LHX6Q9UPM6 363 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.53□□□□□ -0.24
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGER2P43116 358 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMC2Q8TDI7 906 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.47□□□□□ -0.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PBX2P40425 430 aa13.45□□□□□ -0.26
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXK1P85037 733 aa13.38□□□□□ -0.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLPP6Q8IY26 295 aa13.35□□□□□ -0.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSG2Q14126 1118 aa13.34□□□□□ -0.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP33O14559 1287 aa13.32□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.31□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.31□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HRO43593 1189 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSEN2P49810 448 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TK2O00142 265 aa13.24□□□□□ -0.29
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNK17Q96T54 332 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.09□□□□□ -0.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.04□□□□□ -0.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE4AP27815 886 aa12.99□□□□□ -0.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.98□□□□□ -0.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MFSD10Q14728 455 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JPH4Q96JJ6 628 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EVI5O60447 810 aa12.96□□□□□ -0.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.96□□□□□ -0.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNH8Q96L42 1107 aa12.95□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.94□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPREP23469 700 aa12.93□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPN5P54829 565 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STAC3Q96MF2 364 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.89□□□□□ -0.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFFO2Q5TF58 517 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP3K9P80192 1104 aa12.83□□□□□ -0.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNT2BQ93097 391 aa12.82□□□□□ -0.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL9A1P20849 921 aa12.81□□□□□ -0.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.79□□□□□ -0.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROX2Q3B8N5 592 aa12.79□□□□□ -0.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMK2BQ13554 666 aa12.76□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBPF3Q9H094 633 aa12.76□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RABGEF1Q9UJ41 708 aa12.76□□□□□ -0.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0G2JS52 829 aa12.74□□□□□ -0.37
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