RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SYF2-204ENST00000476231 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SYF2-204ENST00000476231 ABCC5O15440 1437 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-204ENST00000476231 ROCK1Q13464 1354 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-204ENST00000476231 MAPKBP1O60336 1514 aa27.89■■■□□ 2.06
SYF2-204ENST00000476231 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.88■■■□□ 2.05
SYF2-204ENST00000476231 PREX2Q70Z35 1606 aa27.86■■■□□ 2.05
SYF2-204ENST00000476231 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.84■■■□□ 2.05
SYF2-204ENST00000476231 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SYF2-204ENST00000476231 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
SYF2-204ENST00000476231 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.83■■■□□ 2.05
SYF2-204ENST00000476231 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.82■■■□□ 2.04
SYF2-204ENST00000476231 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.81■■■□□ 2.04
SYF2-204ENST00000476231 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.8■■■□□ 2.04
SYF2-204ENST00000476231 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SYF2-204ENST00000476231 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-204ENST00000476231 ADGRL2O95490 1459 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.75■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.75■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 KDM6BO15054 1643 aa27.74■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 NCOA1Q15788 1441 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 KCNH8Q96L42 1107 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-204ENST00000476231 MBD5Q9P267 1494 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.66■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 PLCH2O75038 1416 aa27.66■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.66■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.64■■■□□ 2.02
SYF2-204ENST00000476231 TSPY4P0CV99 314 aa27.63■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 TSPY10P0CW01 314 aa27.63■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.62■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.61■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 TRIM52Q96A61 297 aa27.61■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.6■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.6■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 ASXL2Q76L83 1435 aa27.58■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.58■■■□□ 2.01
SYF2-204ENST00000476231 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.57■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.57■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 NEUROD1Q13562 356 aa27.53■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.53■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.53■■■□□ 2
SYF2-204ENST00000476231 ABCC1P33527 1531 aa27.51■■□□□ 1.99
SYF2-204ENST00000476231 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SYF2-204ENST00000476231 KIF15Q9NS87 1388 aa27.48■■□□□ 1.99
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-204ENST00000476231 PLXNC1O60486 1568 aa27.44■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 PZPP20742 1482 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 TONSLQ96HA7 1378 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 FANCAO15360 1455 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-204ENST00000476231 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.38■■□□□ 1.97
SYF2-204ENST00000476231 MIER1Q8N108 512 aa27.37■■□□□ 1.97
SYF2-204ENST00000476231 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.36■■□□□ 1.97
SYF2-204ENST00000476231 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.35■■□□□ 1.97
SYF2-204ENST00000476231 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.33■■□□□ 1.97
SYF2-204ENST00000476231 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 NUP155O75694 1391 aa27.31■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 FOXD1Q16676 465 aa27.29■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 ADGRL1O94910 1474 aa27.29■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.29■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 CD109Q6YHK3 1445 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 UNC13BO14795 1591 aa27.27■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 ERBINQ96RT1 1412 aa27.27■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
SYF2-204ENST00000476231 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.26■■□□□ 1.95
SYF2-204ENST00000476231 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.25■■□□□ 1.95
SYF2-204ENST00000476231 PKD2Q13563 968 aa27.23■■□□□ 1.95
SYF2-204ENST00000476231 AFAP1Q8N556 730 aa27.23■■□□□ 1.95
SYF2-204ENST00000476231 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SYF2-204ENST00000476231 ATP7AQ04656 1500 aa27.2■■□□□ 1.94
SYF2-204ENST00000476231 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.2■■□□□ 1.94
SYF2-204ENST00000476231 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-204ENST00000476231 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-204ENST00000476231 GLI2P10070 1586 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-204ENST00000476231 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-204ENST00000476231 NEO1Q92859 1461 aa27.14■■□□□ 1.93
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.12■■□□□ 1.93
SYF2-204ENST00000476231 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.12■■□□□ 1.93
SYF2-204ENST00000476231 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.11■■□□□ 1.93
SYF2-204ENST00000476231 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.08■■□□□ 1.93
SYF2-204ENST00000476231 KDM5CP41229 1560 aa27.08■■□□□ 1.93
SYF2-204ENST00000476231 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.08■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms