RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 MLECQ14165 292 aa33.55■■■□□ 2.96
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SPDYE2B-202ENST00000455020 EEA1Q15075 1411 aa33.52■■■□□ 2.96
SPDYE2B-202ENST00000455020 PLCH2O75038 1416 aa33.5■■■□□ 2.95
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SPDYE2B-202ENST00000455020 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.47■■■□□ 2.95
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SPDYE2B-202ENST00000455020 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.22■■■□□ 2.91
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SPDYE2B-202ENST00000455020 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.12■■■□□ 2.89
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SPDYE2B-202ENST00000455020 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.11■■■□□ 2.89
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SPDYE2B-202ENST00000455020 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.08■■■□□ 2.89
SPDYE2B-202ENST00000455020 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
SPDYE2B-202ENST00000455020 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.08■■■□□ 2.89
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SPDYE2B-202ENST00000455020 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.03■■■□□ 2.88
SPDYE2B-202ENST00000455020 NCOA1Q15788 1441 aa33.02■■■□□ 2.88
SPDYE2B-202ENST00000455020 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33■■■□□ 2.87
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SPDYE2B-202ENST00000455020 ZMYM3Q14202 1370 aa32.75■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.73■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PLA2R1Q13018 1463 aa32.72■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.72■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
SPDYE2B-202ENST00000455020 PTPRKQ15262 1439 aa32.68■■■□□ 2.82
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SPDYE2B-202ENST00000455020 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.62■■■□□ 2.81
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SPDYE2B-202ENST00000455020 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.59■■■□□ 2.81
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SPDYE2B-202ENST00000455020 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
SPDYE2B-202ENST00000455020 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.48■■■□□ 2.79
SPDYE2B-202ENST00000455020 TIAM1Q13009 1591 aa32.48■■■□□ 2.79
SPDYE2B-202ENST00000455020 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.45■■■□□ 2.79
SPDYE2B-202ENST00000455020 MBD5Q9P267 1494 aa32.41■■■□□ 2.78
SPDYE2B-202ENST00000455020 CPS1P31327 1500 aa32.38■■■□□ 2.77
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
SPDYE2B-202ENST00000455020 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.35■■■□□ 2.77
SPDYE2B-202ENST00000455020 HSPA1LP34931 641 aa32.35■■■□□ 2.77
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