RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454278.5

ZNF638-208, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF638, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-208ENST00000454278 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ZNF638-208ENST00000454278 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.83■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 PLCH2O75038 1416 aa18.82■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 STRCQ7RTU9 1775 aa18.81■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.81■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 ATP10AO60312 1499 aa18.8■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.79■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 KDM5CP41229 1560 aa18.79■□□□□ 0.6
ZNF638-208ENST00000454278 REREQ9P2R6 1566 aa18.76■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 KIF14Q15058 1648 aa18.75■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 MLECQ14165 292 aa18.75■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.75■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.74■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 C3P01024 1663 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF638-208ENST00000454278 ABCA6Q8N139 1617 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 FMN1Q68DA7 1419 aa18.68■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.68■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.68■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.68■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.67■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.66■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.66■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 PTPRTO14522 1441 aa18.66■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 AGLP35573 1532 aa18.65■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 PREX2Q70Z35 1606 aa18.65■□□□□ 0.58
ZNF638-208ENST00000454278 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.64■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.64■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 ABCC1P33527 1531 aa18.64■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.63■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.63■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 ILDR2Q71H61 639 aa18.63■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 SOCS7O14512 581 aa18.62■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.61■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 CLIP1P30622 1438 aa18.61■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 MROH2AA6NES4 1674 aa18.6■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.58■□□□□ 0.57
ZNF638-208ENST00000454278 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 NCOA1Q15788 1441 aa18.57■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 AFAP1Q8N556 730 aa18.56■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.56■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.55■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.54■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
ZNF638-208ENST00000454278 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.52■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 NPATQ14207 1427 aa18.5■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.5■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.49■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.49■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.48■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 PLXNC1O60486 1568 aa18.46■□□□□ 0.55
ZNF638-208ENST00000454278 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 PLA2R1Q13018 1463 aa18.44■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.44■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.43■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 ATP7AQ04656 1500 aa18.41■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
ZNF638-208ENST00000454278 ZMYM3Q14202 1370 aa18.38■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.38■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.36■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 PTPRKQ15262 1439 aa18.34■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 A2MP01023 1474 aa18.33■□□□□ 0.53
ZNF638-208ENST00000454278 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 PKD2Q13563 968 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF638-208ENST00000454278 CPS1P31327 1500 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF638-208ENST00000454278 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TIAM1Q13009 1591 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF638-208ENST00000454278 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 16.2
ZNF638-208ENST00000454278 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF638-208ENST00000454278 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.19■□□□□ 0.5
ZNF638-208ENST00000454278 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.18■□□□□ 0.5
ZNF638-208ENST00000454278 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.18■□□□□ 0.5
ZNF638-208ENST00000454278 GGT6Q6P531 493 aa18.18■□□□□ 0.5
ZNF638-208ENST00000454278 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ZNF638-208ENST00000454278 PZPP20742 1482 aa18.18■□□□□ 0.5
ZNF638-208ENST00000454278 MBD5Q9P267 1494 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms