RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PLCH2O75038 1416 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RICTORQ6R327 1708 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPA2P54652 639 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 AKNAQ7Z591 1439 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-205ENST00000444916 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PREX2Q70Z35 1606 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MLECQ14165 292 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-205ENST00000444916 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CERKQ8TCT0 537 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC1P33527 1531 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 TIAM1Q13009 1591 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM5CP41229 1560 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP10AO60312 1499 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 AFAP1Q8N556 730 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K1Q13233 1512 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 NCOA2Q15596 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 STRCQ7RTU9 1775 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCA6Q8N139 1617 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-205ENST00000444916 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 ILDR2Q71H61 639 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 REREQ9P2R6 1566 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.164e-7■■■■□ 21.3
SH3BP4-205ENST00000444916 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-205ENST00000444916 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 MBD5Q9P267 1494 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 APLP2Q06481 763 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP7AQ04656 1500 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 C3P01024 1663 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 AGLP35573 1532 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-205ENST00000444916 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPRTO14522 1441 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 MIA2Q96PC5 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 SOCS7O14512 581 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 PLXNC1O60486 1568 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-205ENST00000444916 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-205ENST00000444916 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-205ENST00000444916 A2MP01023 1474 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-205ENST00000444916 NCOA1Q15788 1441 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPY4P0CV99 314 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPY10P0CW01 314 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-205ENST00000444916 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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