RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436928.7

SENP6-204, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 5

Gene SENP6, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-204ENST00000436928 KIF14Q15058 1648 aa22.9■■□□□ 1.26
SENP6-204ENST00000436928 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.89■■□□□ 1.25
SENP6-204ENST00000436928 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.89■■□□□ 1.25
SENP6-204ENST00000436928 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.88■■□□□ 1.25
SENP6-204ENST00000436928 PLCH2O75038 1416 aa22.83■■□□□ 1.25
SENP6-204ENST00000436928 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.83■■□□□ 1.25
SENP6-204ENST00000436928 STRCQ7RTU9 1775 aa22.83■■□□□ 1.24
SENP6-204ENST00000436928 MLECQ14165 292 aa22.81■■□□□ 1.24
SENP6-204ENST00000436928 KDM5CP41229 1560 aa22.8■■□□□ 1.24
SENP6-204ENST00000436928 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.79■■□□□ 1.24
SENP6-204ENST00000436928 ATP10AO60312 1499 aa22.78■■□□□ 1.24
SENP6-204ENST00000436928 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.77■■□□□ 1.24
SENP6-204ENST00000436928 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.76■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 ABCA6Q8N139 1617 aa22.76■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 C3P01024 1663 aa22.74■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.74■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.73■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.72■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 CERKQ8TCT0 537 aa22.72■■□□□ 1.23
SENP6-204ENST00000436928 REREQ9P2R6 1566 aa22.7■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 PREX2Q70Z35 1606 aa22.7■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.69■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 FMN1Q68DA7 1419 aa22.69■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.66■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 ABCC1P33527 1531 aa22.65■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.65■■□□□ 1.22
SENP6-204ENST00000436928 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.63■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.63■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.62■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 AFAP1Q8N556 730 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 CLIP1P30622 1438 aa22.58■■□□□ 1.21
SENP6-204ENST00000436928 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 AGLP35573 1532 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 MROH2AA6NES4 1674 aa22.53■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.53■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SENP6-204ENST00000436928 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.5■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.5■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 ILDR2Q71H61 639 aa22.49■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 PTPRTO14522 1441 aa22.48■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.48■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.47■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.47■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.46■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SENP6-204ENST00000436928 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.45■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 NCOA1Q15788 1441 aa22.45■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.45■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.44■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.44■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 PLXNC1O60486 1568 aa22.42■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.4■■□□□ 1.18
SENP6-204ENST00000436928 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.39■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 ATP7AQ04656 1500 aa22.38■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.37■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 NPATQ14207 1427 aa22.36■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.35■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SENP6-204ENST00000436928 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.32■■□□□ 1.16
SENP6-204ENST00000436928 SOCS7O14512 581 aa22.31■■□□□ 1.16
SENP6-204ENST00000436928 ZMYM3Q14202 1370 aa22.28■■□□□ 1.16
SENP6-204ENST00000436928 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SENP6-204ENST00000436928 A2MP01023 1474 aa22.27■■□□□ 1.16
SENP6-204ENST00000436928 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 TIAM1Q13009 1591 aa22.25■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 PLA2R1Q13018 1463 aa22.25■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.25■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 PTPRKQ15262 1439 aa22.24■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP6-204ENST00000436928 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP6-204ENST00000436928 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.14■■□□□ 1.14
SENP6-204ENST00000436928 MBD5Q9P267 1494 aa22.14■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 GGT6Q6P531 493 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 PKD2Q13563 968 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP6-204ENST00000436928 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms