RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429152.6

COX10-202, Transcript of cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene COX10, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10-202ENST00000429152 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.21■■■□□ 2.11
COX10-202ENST00000429152 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
COX10-202ENST00000429152 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.2■■■□□ 2.1
COX10-202ENST00000429152 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.19■■■□□ 2.1
COX10-202ENST00000429152 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.17■■■□□ 2.1
COX10-202ENST00000429152 ATP10AO60312 1499 aa28.16■■■□□ 2.1
COX10-202ENST00000429152 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
COX10-202ENST00000429152 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.12■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 KIF14Q15058 1648 aa28.12■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 HSPA2P54652 639 aa28.12■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 MLECQ14165 292 aa28.12■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.12■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.08■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.08■■■□□ 2.09
COX10-202ENST00000429152 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.07■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 KDM5CP41229 1560 aa28.06■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.06■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 CLIP1P30622 1438 aa28.05■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.04■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.02■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 AFAP1Q8N556 730 aa28.02■■■□□ 2.08
COX10-202ENST00000429152 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
COX10-202ENST00000429152 PREX1Q8TCU6 1659 aa28■■■□□ 2.07
COX10-202ENST00000429152 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28■■■□□ 2.07
COX10-202ENST00000429152 REREQ9P2R6 1566 aa27.99■■■□□ 2.07
COX10-202ENST00000429152 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.95■■■□□ 2.07
COX10-202ENST00000429152 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.95■■■□□ 2.07
COX10-202ENST00000429152 CERKQ8TCT0 537 aa27.94■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.93■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.93■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 PREX2Q70Z35 1606 aa27.92■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 ABCA6Q8N139 1617 aa27.89■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 ABCC1P33527 1531 aa27.89■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.89■■■□□ 2.06
COX10-202ENST00000429152 AGLP35573 1532 aa27.88■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 STRCQ7RTU9 1775 aa27.87■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.86■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.86■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.86■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.85■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.84■■■□□ 2.05
COX10-202ENST00000429152 C3P01024 1663 aa27.82■■■□□ 2.04
COX10-202ENST00000429152 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.81■■■□□ 2.04
COX10-202ENST00000429152 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.79■■■□□ 2.04
COX10-202ENST00000429152 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
COX10-202ENST00000429152 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.75■■■□□ 2.03
COX10-202ENST00000429152 PTPRTO14522 1441 aa27.72■■■□□ 2.03
COX10-202ENST00000429152 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.72■■■□□ 2.03
COX10-202ENST00000429152 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
COX10-202ENST00000429152 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.67■■■□□ 2.02
COX10-202ENST00000429152 MROH2AA6NES4 1674 aa27.66■■■□□ 2.02
COX10-202ENST00000429152 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
COX10-202ENST00000429152 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.66■■■□□ 2.02
COX10-202ENST00000429152 NPATQ14207 1427 aa27.65■■■□□ 2.02
COX10-202ENST00000429152 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.63■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 NCOA1Q15788 1441 aa27.61■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 ZMYM3Q14202 1370 aa27.6■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 ATP7AQ04656 1500 aa27.59■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 PLXNC1O60486 1568 aa27.58■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
COX10-202ENST00000429152 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.56■■■□□ 2
COX10-202ENST00000429152 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.56■■■□□ 2
COX10-202ENST00000429152 A2MP01023 1474 aa27.54■■■□□ 2
COX10-202ENST00000429152 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.53■■■□□ 2
COX10-202ENST00000429152 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.52■■■□□ 2
COX10-202ENST00000429152 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
COX10-202ENST00000429152 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.5■■□□□ 1.99
COX10-202ENST00000429152 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.5■■□□□ 1.99
COX10-202ENST00000429152 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.48■■□□□ 1.99
COX10-202ENST00000429152 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
COX10-202ENST00000429152 PTPRKQ15262 1439 aa27.46■■□□□ 1.99
COX10-202ENST00000429152 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.45■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 PLA2R1Q13018 1463 aa27.44■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 MBD5Q9P267 1494 aa27.44■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 TIAM1Q13009 1591 aa27.43■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 GGT6Q6P531 493 aa27.43■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.42■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.41■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.41■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 PKD2Q13563 968 aa27.41■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.41■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 CEP162Q5TB80 1403 aa27.4■■□□□ 1.98
COX10-202ENST00000429152 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
COX10-202ENST00000429152 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
COX10-202ENST00000429152 ILDR2Q71H61 639 aa27.34■■□□□ 1.97
COX10-202ENST00000429152 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
COX10-202ENST00000429152 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.31■■□□□ 1.96
COX10-202ENST00000429152 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.3■■□□□ 1.96
COX10-202ENST00000429152 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.29■■□□□ 1.96
COX10-202ENST00000429152 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
COX10-202ENST00000429152 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.28■■□□□ 1.96
COX10-202ENST00000429152 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms