RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC7Q96M83 1385 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0556O60303 1618 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 PDS5BQ9NTI5 1447 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP160Q12769 1436 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2R1Q13018 1463 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA8O94911 1581 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM52Q96A61 297 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 TONSLQ96HA7 1378 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM5CP41229 1560 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 PBRM1Q86U86 1689 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIN2AQ12879 1464 aa5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF14Q15058 1648 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PCH4 1651 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP8Q14318 412 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED9Q6R2W3 1325 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 MRC2Q9UBG0 1479 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP170Q5SW79 1584 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT140Q96RY7 1462 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP10AO60312 1499 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXD1Q16676 465 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNJ2O15056 1496 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP10BO94823 1461 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 INSRP06213 1382 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 BCANQ96GW7 911 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF5Q12774 1597 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 ANP32CO43423 234 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 TESK2Q96S53 571 aa5.09□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.09□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 USP47Q96K76 1375 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMC1P11047 1609 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC13BO14795 1591 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF521Q96K83 1311 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 A2MP01023 1474 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 SHROOM2Q13796 1616 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXNC1O60486 1568 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL11AQ9H165 835 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PREX2Q70Z35 1606 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-203ENST00000419445 PKD2Q13563 968 aa5.02□□□□□ -1.61
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