RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPNS2Q8IVW8 549 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-55P-201ENST00000411092 MMRN1Q13201 1228 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RNU6-55P-201ENST00000411092 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-55P-201ENST00000411092 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-55P-201ENST00000411092 DOK7Q18PE1 504 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP1R37O75864 691 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-55P-201ENST00000411092 ERBB3P21860 1342 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR153Q6NV75 609 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 C2orf72A6NCS6 295 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 RIMBP2O15034 1052 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIF3CO14782 793 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARSIQ5FYB1 569 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMC2Q8TDI7 906 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-55P-201ENST00000411092 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUDT7P0C024 238 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC34A2O95436 690 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOXK1P85037 733 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLPP6Q8IY26 295 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-55P-201ENST00000411092 DSG2Q14126 1118 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 LHX6Q9UPM6 363 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDE4AP27815 886 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D12O60347 775 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 OXER1Q8TDS5 423 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTGER2P43116 358 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-55P-201ENST00000411092 PBX2P40425 430 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 MFSD10Q14728 455 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 PSEN2P49810 448 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFAP44Q96MT7 982 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP33O14559 1287 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAP3K9P80192 1104 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 EVI5O60447 810 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 HRO43593 1189 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 CAMK2BQ13554 666 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOSBP53539 338 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNK17Q96T54 332 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-55P-201ENST00000411092 TK2O00142 265 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 JPH4Q96JJ6 628 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNH8Q96L42 1107 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 DPYSL4O14531 572 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 HCSTQ9UBK5 93 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPREP23469 700 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR70Q9NW82 654 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-55P-201ENST00000411092 PHF14O94880 888 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 E2F4Q16254 413 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXW7Q969H0 707 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 STAC3Q96MF2 364 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-55P-201ENST00000411092 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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