RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400824.8

AFDN-208, Transcript of afadin, adherens junction formation factor, human

TSL 5

Gene AFDN, Length 875 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFDN-208	ENST00000400824	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.65	■■■■■ 4.58
AFDN-208	ENST00000400824	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.65	■■■■■ 4.58
AFDN-208	ENST00000400824	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.64	■■■■■ 4.58
AFDN-208	ENST00000400824	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43.64	■■■■■ 4.58
AFDN-208	ENST00000400824	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.61	■■■■■ 4.57
AFDN-208	ENST00000400824	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.61	■■■■■ 4.57
AFDN-208	ENST00000400824	MLEC	Q14165	292 aa		43.6	■■■■■ 4.57
AFDN-208	ENST00000400824	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.6	■■■■■ 4.57
AFDN-208	ENST00000400824	HSPA2	P54652	639 aa		43.59	■■■■■ 4.57
AFDN-208	ENST00000400824	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.58	■■■■■ 4.57
AFDN-208	ENST00000400824	KIF14	Q15058	1648 aa		43.56	■■■■■ 4.56
AFDN-208	ENST00000400824	ATP10A	O60312	1499 aa		43.56	■■■■■ 4.56
AFDN-208	ENST00000400824	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.51	■■■■■ 4.56
AFDN-208	ENST00000400824	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.5	■■■■■ 4.55
AFDN-208	ENST00000400824	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
AFDN-208	ENST00000400824	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.46	■■■■■ 4.55
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.44	■■■■■ 4.54
AFDN-208	ENST00000400824	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.42	■■■■■ 4.54
AFDN-208	ENST00000400824	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.4	■■■■■ 4.54
AFDN-208	ENST00000400824	KDM5C	P41229	1560 aa		43.4	■■■■■ 4.54
AFDN-208	ENST00000400824	CLIP1	P30622	1438 aa		43.39	■■■■■ 4.54
AFDN-208	ENST00000400824	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.37	■■■■■ 4.53
AFDN-208	ENST00000400824	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.33	■■■■■ 4.53
AFDN-208	ENST00000400824	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.33	■■■■■ 4.53
AFDN-208	ENST00000400824	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
AFDN-208	ENST00000400824	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.28	■■■■■ 4.52
AFDN-208	ENST00000400824	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.24	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.23	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.22	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.22	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.22	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.2	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.2	■■■■■ 4.51
AFDN-208	ENST00000400824	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.19	■■■■■ 4.5
AFDN-208	ENST00000400824	ABCC1	P33527	1531 aa		43.17	■■■■■ 4.5
AFDN-208	ENST00000400824	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.15	■■■■■ 4.5
AFDN-208	ENST00000400824	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.13	■■■■■ 4.49
AFDN-208	ENST00000400824	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.11	■■■■■ 4.49
AFDN-208	ENST00000400824	AGL	P35573	1532 aa		43.11	■■■■■ 4.49
AFDN-208	ENST00000400824	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.1	■■■■■ 4.49
AFDN-208	ENST00000400824	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.08	■■■■■ 4.49
AFDN-208	ENST00000400824	C3	P01024	1663 aa		43.06	■■■■■ 4.48
AFDN-208	ENST00000400824	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.04	■■■■■ 4.48
AFDN-208	ENST00000400824	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.03	■■■■■ 4.48
AFDN-208	ENST00000400824	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43	■■■■■ 4.47
AFDN-208	ENST00000400824	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
AFDN-208	ENST00000400824	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.91	■■■■■ 4.46
AFDN-208	ENST00000400824	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.88	■■■■■ 4.45
AFDN-208	ENST00000400824	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
AFDN-208	ENST00000400824	PTPRT	O14522	1441 aa		42.86	■■■■■ 4.45
AFDN-208	ENST00000400824	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.83	■■■■■ 4.45
AFDN-208	ENST00000400824	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
AFDN-208	ENST00000400824	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.78	■■■■■ 4.44	4e-7	■■■■■ 31.8
AFDN-208	ENST00000400824	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.78	■■■■■ 4.44
AFDN-208	ENST00000400824	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
AFDN-208	ENST00000400824	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.73	■■■■■ 4.43
AFDN-208	ENST00000400824	NPAT	Q14207	1427 aa		42.71	■■■■■ 4.43
AFDN-208	ENST00000400824	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.71	■■■■■ 4.43
AFDN-208	ENST00000400824	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.71	■■■■■ 4.43
AFDN-208	ENST00000400824	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.69	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.69	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.66	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.66	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.65	■■■■■ 4.42
AFDN-208	ENST00000400824	A2M	P01023	1474 aa		42.62	■■■■■ 4.41
AFDN-208	ENST00000400824	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.61	■■■■■ 4.41
AFDN-208	ENST00000400824	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
AFDN-208	ENST00000400824	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.58	■■■■■ 4.41
AFDN-208	ENST00000400824	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.53	■■■■■ 4.4
AFDN-208	ENST00000400824	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.51	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.49	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.49	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	GGT6	Q6P531	493 aa		42.49	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.49	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.47	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.46	■■■■■ 4.39
AFDN-208	ENST00000400824	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.44	■■■■■ 4.38
AFDN-208	ENST00000400824	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.44	■■■■■ 4.38
AFDN-208	ENST00000400824	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.43	■■■■■ 4.38
AFDN-208	ENST00000400824	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.42	■■■■■ 4.38
AFDN-208	ENST00000400824	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.42	■■■■■ 4.38
AFDN-208	ENST00000400824	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.37	■■■■■ 4.37
AFDN-208	ENST00000400824	PKD2	Q13563	968 aa		42.37	■■■■■ 4.37
AFDN-208	ENST00000400824	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.37	■■■■■ 4.37
AFDN-208	ENST00000400824	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.37	■■■■■ 4.37
AFDN-208	ENST00000400824	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
AFDN-208	ENST00000400824	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
AFDN-208	ENST00000400824	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.27	■■■■■ 4.36
AFDN-208	ENST00000400824	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.24	■■■■■ 4.35
AFDN-208	ENST00000400824	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
AFDN-208	ENST00000400824	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.2	■■■■■ 4.35
AFDN-208	ENST00000400824	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.18	■■■■■ 4.34
AFDN-208	ENST00000400824	SOCS7	O14512	581 aa		42.17	■■■■■ 4.34

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