RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 ANP32CO43423 234 aa32.61■■■□□ 2.81
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RABGGTA-202ENST00000399409 NUP160Q12769 1436 aa32.55■■■□□ 2.8
RABGGTA-202ENST00000399409 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.54■■■□□ 2.8
RABGGTA-202ENST00000399409 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
RABGGTA-202ENST00000399409 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.53■■■□□ 2.8
RABGGTA-202ENST00000399409 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
RABGGTA-202ENST00000399409 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.47■■■□□ 2.79
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
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RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.44■■■□□ 2.78
RABGGTA-202ENST00000399409 JPH4Q96JJ6 628 aa32.43■■■□□ 2.78
RABGGTA-202ENST00000399409 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
RABGGTA-202ENST00000399409 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.42■■■□□ 2.78
RABGGTA-202ENST00000399409 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
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RABGGTA-202ENST00000399409 FBLN2P98095 1184 aa32.39■■■□□ 2.78
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RABGGTA-202ENST00000399409 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.35■■■□□ 2.77
RABGGTA-202ENST00000399409 NCOA1Q15788 1441 aa32.34■■■□□ 2.77
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RABGGTA-202ENST00000399409 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.31■■■□□ 2.76
RABGGTA-202ENST00000399409 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.28■■■□□ 2.76
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RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.26■■■□□ 2.75
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RABGGTA-202ENST00000399409 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.21■■■□□ 2.75
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RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.18■■■□□ 2.74
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RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC7Q96M83 1385 aa32.14■■■□□ 2.74
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.12■■■□□ 2.73
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RABGGTA-202ENST00000399409 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
RABGGTA-202ENST00000399409 NEFLP07196 543 aa32.07■■■□□ 2.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PTPRGP23470 1445 aa32.07■■■□□ 2.72
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RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.9■■■□□ 2.7
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.9■■■□□ 2.7
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RABGGTA-202ENST00000399409 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.87■■■□□ 2.69
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RABGGTA-202ENST00000399409 PLXNC1O60486 1568 aa31.65■■■□□ 2.66
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RABGGTA-202ENST00000399409 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.65■■■□□ 2.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.64■■■□□ 2.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.59■■■□□ 2.65
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