RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381486.6

GREB1-204, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GREB1, Length 8,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-204ENST00000381486 CCER2I3L3R5 266 aa14.87□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 KCNH8Q96L42 1107 aa14.87□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.86□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 GPATCH3Q96I76 525 aa14.85□□□□□ -0.03
GREB1-204ENST00000381486 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.79□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.79□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.78□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 MORC1Q86VD1 984 aa14.78□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
GREB1-204ENST00000381486 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 KIF3AQ9Y496 699 aa14.76□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.75□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 NACADO15069 1562 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 RALBP1Q15311 655 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 TPM3P06753 285 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 CEP89Q96ST8 783 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 HMMRO75330 724 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 ST18O60284 1047 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-204ENST00000381486 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 GPS2Q13227 327 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.68□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 KIF16BQ96L93 1317 aa14.67□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 GORABQ5T7V8 394 aa14.67□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.66□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.66□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.66□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 STK31Q9BXU1 1019 aa14.65□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.65□□□□□ -0.06
GREB1-204ENST00000381486 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 TPM1P09493 284 aa14.64□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 ERCC6Q03468 1493 aa14.64□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 ARID3AQ99856 593 aa14.64□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 APBB1O00213 710 aa14.63□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.63□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 TPM2P07951 284 aa14.63□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.62□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.62□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.072e-9■■■□□ 14.7
GREB1-204ENST00000381486 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 PDE3BQ13370 1112 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 TEX35Q5T0J7 233 aa14.59□□□□□ -0.07
GREB1-204ENST00000381486 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.57□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 H3BQV1 296 aa14.57□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 IFFO2Q5TF58 517 aa14.57□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 SOX12O15370 315 aa14.57□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.57□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.55□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GREB1-204ENST00000381486 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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