RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ACSS1-202ENST00000376726 ROCK1Q13464 1354 aa35.06■■■■□ 3.2
ACSS1-202ENST00000376726 PTPRGP23470 1445 aa35.03■■■■□ 3.2
ACSS1-202ENST00000376726 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
ACSS1-202ENST00000376726 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.01■■■■□ 3.2
ACSS1-202ENST00000376726 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
ACSS1-202ENST00000376726 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35■■■■□ 3.19
ACSS1-202ENST00000376726 SHROOM2Q13796 1616 aa35■■■■□ 3.19
ACSS1-202ENST00000376726 TRIM52Q96A61 297 aa34.97■■■■□ 3.19
ACSS1-202ENST00000376726 TONSLQ96HA7 1378 aa34.96■■■■□ 3.19
ACSS1-202ENST00000376726 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.92■■■■□ 3.18
ACSS1-202ENST00000376726 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.91■■■■□ 3.18
ACSS1-202ENST00000376726 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
ACSS1-202ENST00000376726 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.86■■■■□ 3.17
ACSS1-202ENST00000376726 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.85■■■■□ 3.17
ACSS1-202ENST00000376726 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.84■■■■□ 3.17
ACSS1-202ENST00000376726 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.81■■■■□ 3.16
ACSS1-202ENST00000376726 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.81■■■■□ 3.16
ACSS1-202ENST00000376726 NCOA1Q15788 1441 aa34.79■■■■□ 3.16
ACSS1-202ENST00000376726 ADGRL2O95490 1459 aa34.79■■■■□ 3.16
ACSS1-202ENST00000376726 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.78■■■■□ 3.16
ACSS1-202ENST00000376726 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.73■■■■□ 3.15
ACSS1-202ENST00000376726 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.69■■■■□ 3.14
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC2Q92887 1545 aa34.69■■■■□ 3.14
ACSS1-202ENST00000376726 FOXD1Q16676 465 aa34.67■■■■□ 3.14
ACSS1-202ENST00000376726 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.66■■■■□ 3.14
ACSS1-202ENST00000376726 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.64■■■■□ 3.14
ACSS1-202ENST00000376726 PREX2Q70Z35 1606 aa34.63■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.62■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 PZPP20742 1482 aa34.61■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.61■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.59■■■■□ 3.13
ACSS1-202ENST00000376726 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.56■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.56■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 MBD5Q9P267 1494 aa34.55■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 TSPY4P0CV99 314 aa34.54■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 TSPY10P0CW01 314 aa34.54■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.54■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
ACSS1-202ENST00000376726 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.51■■■■□ 3.11
ACSS1-202ENST00000376726 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.49■■■■□ 3.11
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.47■■■■□ 3.11
ACSS1-202ENST00000376726 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ACSS1-202ENST00000376726 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.44■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.44■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.43■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.43■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.43■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 KIF15Q9NS87 1388 aa34.42■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.39■■■■□ 3.1
ACSS1-202ENST00000376726 PKD2Q13563 968 aa34.38■■■■□ 3.09
ACSS1-202ENST00000376726 KCNH8Q96L42 1107 aa34.37■■■■□ 3.09
ACSS1-202ENST00000376726 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.36■■■■□ 3.09
ACSS1-202ENST00000376726 NUP155O75694 1391 aa34.35■■■■□ 3.09
ACSS1-202ENST00000376726 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.32■■■■□ 3.08
ACSS1-202ENST00000376726 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
ACSS1-202ENST00000376726 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.31■■■■□ 3.08
ACSS1-202ENST00000376726 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.29■■■■□ 3.08
ACSS1-202ENST00000376726 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
ACSS1-202ENST00000376726 PLCH2O75038 1416 aa34.27■■■■□ 3.08
ACSS1-202ENST00000376726 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.21■■■■□ 3.07
ACSS1-202ENST00000376726 PLXNC1O60486 1568 aa34.18■■■■□ 3.06
ACSS1-202ENST00000376726 ANP32CO43423 234 aa34.18■■■■□ 3.06
ACSS1-202ENST00000376726 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.18■■■■□ 3.06
ACSS1-202ENST00000376726 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.16■■■■□ 3.06
ACSS1-202ENST00000376726 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.14■■■■□ 3.06
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC1P33527 1531 aa34.13■■■■□ 3.05
ACSS1-202ENST00000376726 UNC13BO14795 1591 aa34.11■■■■□ 3.05
ACSS1-202ENST00000376726 CCER2I3L3R5 266 aa34.1■■■■□ 3.05
ACSS1-202ENST00000376726 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.08■■■■□ 3.05
ACSS1-202ENST00000376726 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.08■■■■□ 3.05
ACSS1-202ENST00000376726 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.08■■■■□ 3.05
ACSS1-202ENST00000376726 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.06■■■■□ 3.04
ACSS1-202ENST00000376726 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
ACSS1-202ENST00000376726 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.03■■■■□ 3.04
ACSS1-202ENST00000376726 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC7Q96M83 1385 aa34■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 ERBINQ96RT1 1412 aa33.99■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 OSCARQ8IYS5 282 aa33.99■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.99■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.95■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
ACSS1-202ENST00000376726 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.94■■■■□ 3.02
ACSS1-202ENST00000376726 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.94■■■■□ 3.02
ACSS1-202ENST00000376726 ASXL2Q76L83 1435 aa33.9■■■■□ 3.02
ACSS1-202ENST00000376726 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.9■■■■□ 3.02
ACSS1-202ENST00000376726 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.9■■■■□ 3.02
ACSS1-202ENST00000376726 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
ACSS1-202ENST00000376726 FANCAO15360 1455 aa33.88■■■■□ 3.01
ACSS1-202ENST00000376726 PLA2R1Q13018 1463 aa33.88■■■■□ 3.01
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