RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 NAIPQ13075 1403 aa40.37■■■■■ 4.05
MSRB2-201ENST00000376510 AKNAQ7Z591 1439 aa40.34■■■■■ 4.05
MSRB2-201ENST00000376510 ABCC5O15440 1437 aa40.33■■■■■ 4.05
MSRB2-201ENST00000376510 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.3■■■■■ 4.04
MSRB2-201ENST00000376510 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.28■■■■■ 4.04
MSRB2-201ENST00000376510 PREX2Q70Z35 1606 aa40.26■■■■■ 4.04
MSRB2-201ENST00000376510 KCNH8Q96L42 1107 aa40.26■■■■■ 4.04
MSRB2-201ENST00000376510 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.034e-9■■■■■ 40.6
MSRB2-201ENST00000376510 ROCK1Q13464 1354 aa40.26■■■■■ 4.03
MSRB2-201ENST00000376510 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.22■■■■■ 4.03
MSRB2-201ENST00000376510 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.22■■■■■ 4.03
MSRB2-201ENST00000376510 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.17■■■■■ 4.02
MSRB2-201ENST00000376510 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.16■■■■■ 4.02
MSRB2-201ENST00000376510 MAPKBP1O60336 1514 aa40.14■■■■■ 4.02
MSRB2-201ENST00000376510 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.13■■■■■ 4.01
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.13■■■■■ 4.01
MSRB2-201ENST00000376510 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
MSRB2-201ENST00000376510 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.1■■■■■ 4.01
MSRB2-201ENST00000376510 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
MSRB2-201ENST00000376510 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.08■■■■■ 4.01
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.06■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 ADGRL2O95490 1459 aa40.05■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.04■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 TSPY4P0CV99 314 aa40.04■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 TSPY10P0CW01 314 aa40.04■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.03■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 PLCH2O75038 1416 aa40.03■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.03■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 NCOA1Q15788 1441 aa40.02■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 KDM6BO15054 1643 aa40.01■■■■■ 4
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM52Q96A61 297 aa40■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.99■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 ASXL2Q76L83 1435 aa39.99■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 MBD5Q9P267 1494 aa39.98■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.97■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.96■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.96■■■■□ 3.99
MSRB2-201ENST00000376510 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.92■■■■□ 3.98
MSRB2-201ENST00000376510 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.91■■■■□ 3.98
MSRB2-201ENST00000376510 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.89■■■■□ 3.98
MSRB2-201ENST00000376510 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.87■■■■□ 3.97
MSRB2-201ENST00000376510 NEUROD1Q13562 356 aa39.82■■■■□ 3.97
MSRB2-201ENST00000376510 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.82■■■■□ 3.97
MSRB2-201ENST00000376510 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.79■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.79■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.78■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.77■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 ABCC1P33527 1531 aa39.75■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.75■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 KIF15Q9NS87 1388 aa39.75■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.72■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 FANCAO15360 1455 aa39.69■■■■□ 3.94
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
MSRB2-201ENST00000376510 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
MSRB2-201ENST00000376510 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
MSRB2-201ENST00000376510 PLXNC1O60486 1568 aa39.61■■■■□ 3.93
MSRB2-201ENST00000376510 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.6■■■■□ 3.93
MSRB2-201ENST00000376510 TONSLQ96HA7 1378 aa39.58■■■■□ 3.93
MSRB2-201ENST00000376510 CD109Q6YHK3 1445 aa39.56■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 PZPP20742 1482 aa39.56■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 ADGRL1O94910 1474 aa39.54■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 NUP155O75694 1391 aa39.51■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.5■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.5■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 FOXD1Q16676 465 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 AFAP1Q8N556 730 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.47■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.45■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
MSRB2-201ENST00000376510 ERBINQ96RT1 1412 aa39.41■■■■□ 3.9
MSRB2-201ENST00000376510 PKD2Q13563 968 aa39.4■■■■□ 3.9
MSRB2-201ENST00000376510 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.39■■■■□ 3.9
MSRB2-201ENST00000376510 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.35■■■■□ 3.89
MSRB2-201ENST00000376510 UNC13BO14795 1591 aa39.35■■■■□ 3.89
MSRB2-201ENST00000376510 ATP7AQ04656 1500 aa39.34■■■■□ 3.89
MSRB2-201ENST00000376510 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
MSRB2-201ENST00000376510 GLI2P10070 1586 aa39.31■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.31■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 NEO1Q92859 1461 aa39.29■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.28■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.28■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
MSRB2-201ENST00000376510 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.21■■■■□ 3.87
MSRB2-201ENST00000376510 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.2■■■■□ 3.87
MSRB2-201ENST00000376510 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.19■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.18■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 DIP2BQ9P265 1576 aa39.16■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.15■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.15■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 KDM5CP41229 1560 aa39.15■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms