RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 GRIN2AQ12879 1464 aa13.64□□□□□ -0.23
TTPAL-202ENST00000372904 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.64□□□□□ -0.23
TTPAL-202ENST00000372904 SYNJ2O15056 1496 aa13.63□□□□□ -0.23
TTPAL-202ENST00000372904 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.63□□□□□ -0.23
TTPAL-202ENST00000372904 FKBP8Q14318 412 aa13.62□□□□□ -0.23
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TTPAL-202ENST00000372904 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TTPAL-202ENST00000372904 GGT6Q6P531 493 aa13.61□□□□□ -0.23
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TTPAL-202ENST00000372904 CEP170Q5SW79 1584 aa13.31□□□□□ -0.28
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TTPAL-202ENST00000372904 SAMD9Q5K651 1589 aa13.31□□□□□ -0.28
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TTPAL-202ENST00000372904 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPAL-202ENST00000372904 ATP10BO94823 1461 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPAL-202ENST00000372904 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPAL-202ENST00000372904 AKNAQ7Z591 1439 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPAL-202ENST00000372904 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPAL-202ENST00000372904 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
TTPAL-202ENST00000372904 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-202ENST00000372904 MORC1Q86VD1 984 aa13.26□□□□□ -0.29
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