RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369306.7

PEX11B-201, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 11 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PEX11B, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11B-201ENST00000369306 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.45■■□□□ 1.18
PEX11B-201ENST00000369306 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.44■■□□□ 1.18
PEX11B-201ENST00000369306 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.41■■□□□ 1.18
PEX11B-201ENST00000369306 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.4■■□□□ 1.18
PEX11B-201ENST00000369306 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PEX11B-201ENST00000369306 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.37■■□□□ 1.17
PEX11B-201ENST00000369306 KDM6BO15054 1643 aa22.35■■□□□ 1.17
PEX11B-201ENST00000369306 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PEX11B-201ENST00000369306 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.34■■□□□ 1.17
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PEX11B-201ENST00000369306 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.33■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 ADGRL2O95490 1459 aa22.32■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.31■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 NCOA1Q15788 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 PREX2Q70Z35 1606 aa22.29■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.29■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 NEUROD1Q13562 356 aa22.28■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.28■■□□□ 1.16
PEX11B-201ENST00000369306 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.25■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.25■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 OSCARQ8IYS5 282 aa22.25■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 TRIM52Q96A61 297 aa22.25■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.25■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.24■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 MBD5Q9P267 1494 aa22.23■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.22■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.22■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.21■■□□□ 1.15
PEX11B-201ENST00000369306 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.19■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 TSPY4P0CV99 314 aa22.17■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 TSPY10P0CW01 314 aa22.17■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.17■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.17■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.16■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 KCNH8Q96L42 1107 aa22.16■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 TONSLQ96HA7 1378 aa22.16■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 PLCH2O75038 1416 aa22.15■■□□□ 1.14
PEX11B-201ENST00000369306 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.14■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.14■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.13■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.11■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 PZPP20742 1482 aa22.11■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.09■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.09■■□□□ 1.13
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PEX11B-201ENST00000369306 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.08■■□□□ 1.13
PEX11B-201ENST00000369306 KIF15Q9NS87 1388 aa22.08■■□□□ 1.12
PEX11B-201ENST00000369306 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.07■■□□□ 1.12
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PEX11B-201ENST00000369306 FOXD1Q16676 465 aa22.04■■□□□ 1.12
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PEX11B-201ENST00000369306 ABCC1P33527 1531 aa22.01■■□□□ 1.11
PEX11B-201ENST00000369306 ASXL2Q76L83 1435 aa22■■□□□ 1.11
PEX11B-201ENST00000369306 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.99■■□□□ 1.11
PEX11B-201ENST00000369306 PLXNC1O60486 1568 aa21.99■■□□□ 1.11
PEX11B-201ENST00000369306 NUP155O75694 1391 aa21.97■■□□□ 1.11
PEX11B-201ENST00000369306 PKD2Q13563 968 aa21.94■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 MIER1Q8N108 512 aa21.94■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.92■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.91■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.91■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 FANCAO15360 1455 aa21.9■■□□□ 1.1
PEX11B-201ENST00000369306 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.88■■□□□ 1.09
PEX11B-201ENST00000369306 UNC13BO14795 1591 aa21.88■■□□□ 1.09
PEX11B-201ENST00000369306 ERBINQ96RT1 1412 aa21.88■■□□□ 1.09
PEX11B-201ENST00000369306 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.86■■□□□ 1.09
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PEX11B-201ENST00000369306 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.83■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.81■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 ADGRL1O94910 1474 aa21.81■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.79■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.79■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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PEX11B-201ENST00000369306 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.77■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.77■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.77■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.77■■□□□ 1.08
PEX11B-201ENST00000369306 CD109Q6YHK3 1445 aa21.76■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 ATP7AQ04656 1500 aa21.75■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.73■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PEX11B-201ENST00000369306 PLA2R1Q13018 1463 aa21.69■■□□□ 1.06
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.69■■□□□ 1.06
PEX11B-201ENST00000369306 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.69■■□□□ 1.06
PEX11B-201ENST00000369306 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.68■■□□□ 1.06
PEX11B-201ENST00000369306 ATP10AO60312 1499 aa21.68■■□□□ 1.06
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