RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360507.9

CNPPD1-201, Transcript of cyclin Pas1/PHO80 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNPPD1, Length 2,060 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1-201ENST00000360507 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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CNPPD1-201ENST00000360507 MSH5O43196 834 aa23.15■■□□□ 1.3
CNPPD1-201ENST00000360507 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.15■■□□□ 1.3
CNPPD1-201ENST00000360507 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.15■■□□□ 1.3
CNPPD1-201ENST00000360507 PBRM1Q86U86 1689 aa23.14■■□□□ 1.3
CNPPD1-201ENST00000360507 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CNPPD1-201ENST00000360507 ADAMTS12P58397 1594 aa23.12■■□□□ 1.29
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CNPPD1-201ENST00000360507 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.1■■□□□ 1.29
CNPPD1-201ENST00000360507 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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CNPPD1-201ENST00000360507 ABCC5O15440 1437 aa23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1-201ENST00000360507 CCDC184Q52MB2 194 aa23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1-201ENST00000360507 MRS2Q9HD23 443 aa23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1-201ENST00000360507 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
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CNPPD1-201ENST00000360507 MBD5Q9P267 1494 aa23.01■■□□□ 1.27
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CNPPD1-201ENST00000360507 PZPP20742 1482 aa22.96■■□□□ 1.27
CNPPD1-201ENST00000360507 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.95■■□□□ 1.26
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CNPPD1-201ENST00000360507 KIAA0556O60303 1618 aa22.95■■□□□ 1.26
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CNPPD1-201ENST00000360507 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.94■■□□□ 1.26
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CNPPD1-201ENST00000360507 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.9■■□□□ 1.26
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CNPPD1-201ENST00000360507 USP47Q96K76 1375 aa22.83■■□□□ 1.24
CNPPD1-201ENST00000360507 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.81■■□□□ 1.24
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CNPPD1-201ENST00000360507 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1-201ENST00000360507 GRIN2AQ12879 1464 aa22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1-201ENST00000360507 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1-201ENST00000360507 KIF15Q9NS87 1388 aa22.71■■□□□ 1.23
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CNPPD1-201ENST00000360507 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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CNPPD1-201ENST00000360507 E9PCH4 1651 aa22.68■■□□□ 1.22
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CNPPD1-201ENST00000360507 PKD2Q13563 968 aa22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1-201ENST00000360507 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1-201ENST00000360507 CEP170Q5SW79 1584 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNPPD1-201ENST00000360507 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.58■■□□□ 1.21
CNPPD1-201ENST00000360507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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CNPPD1-201ENST00000360507 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.57■■□□□ 1.2
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CNPPD1-201ENST00000360507 PDE3BQ13370 1112 aa22.55■■□□□ 1.2
CNPPD1-201ENST00000360507 NUP155O75694 1391 aa22.55■■□□□ 1.2
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CNPPD1-201ENST00000360507 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1-201ENST00000360507 SYNJ2O15056 1496 aa22.52■■□□□ 1.19
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