RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 NAIPQ13075 1403 aa21.7■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SHROOM2Q13796 1616 aa21.7■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 HFM1A2PYH4 1435 aa21.69■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 KIF14Q15058 1648 aa21.69■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MIA2Q96PC5 1412 aa21.69■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.68■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
LRRTM1-201ENST00000295057 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCC5O15440 1437 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 KDM6BO15054 1643 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 OSCARQ8IYS5 282 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 DAPK1P53355 1430 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 UACAQ9BZF9 1416 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRTM1-201ENST00000295057 TRIM52Q96A61 297 aa21.57■■□□□ 1.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.52■■□□□ 1.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.52■■□□□ 1.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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LRRTM1-201ENST00000295057 FOXD1Q16676 465 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRTM1-201ENST00000295057 NEFLP07196 543 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRTM1-201ENST00000295057 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRTM1-201ENST00000295057 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
LRRTM1-201ENST00000295057 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 AKNAQ7Z591 1439 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 MSH5O43196 834 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCC2Q92887 1545 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ROCK1Q13464 1354 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 NCOA1Q15788 1441 aa21.39■■□□□ 1.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TONSLQ96HA7 1378 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRTM1-201ENST00000295057 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRTM1-201ENST00000295057 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
LRRTM1-201ENST00000295057 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.33■■□□□ 1
LRRTM1-201ENST00000295057 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LRRTM1-201ENST00000295057 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.32■■□□□ 1
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LRRTM1-201ENST00000295057 TSPY10P0CW01 314 aa21.32■■□□□ 1
LRRTM1-201ENST00000295057 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.31■■□□□ 1
LRRTM1-201ENST00000295057 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.31■■□□□ 1
LRRTM1-201ENST00000295057 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.31■■□□□ 1
LRRTM1-201ENST00000295057 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.3■■□□□ 1
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LRRTM1-201ENST00000295057 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.29■■□□□ 1
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LRRTM1-201ENST00000295057 CCER2I3L3R5 266 aa21.29■■□□□ 1
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LRRTM1-201ENST00000295057 ADGRL2O95490 1459 aa21.28■■□□□ 1
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LRRTM1-201ENST00000295057 PZPP20742 1482 aa21.24■□□□□ 0.99
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LRRTM1-201ENST00000295057 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.23■□□□□ 0.99
LRRTM1-201ENST00000295057 KIF15Q9NS87 1388 aa21.23■□□□□ 0.99
LRRTM1-201ENST00000295057 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.21■□□□□ 0.99
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.2■□□□□ 0.98
LRRTM1-201ENST00000295057 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.2■□□□□ 0.98
LRRTM1-201ENST00000295057 PKD2Q13563 968 aa21.2■□□□□ 0.98
LRRTM1-201ENST00000295057 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.2■□□□□ 0.98
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LRRTM1-201ENST00000295057 NUP155O75694 1391 aa21.18■□□□□ 0.98
LRRTM1-201ENST00000295057 PLCH2O75038 1416 aa21.17■□□□□ 0.98
LRRTM1-201ENST00000295057 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.16■□□□□ 0.98
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LRRTM1-201ENST00000295057 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.14■□□□□ 0.97
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LRRTM1-201ENST00000295057 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.13■□□□□ 0.97
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LRRTM1-201ENST00000295057 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.04■□□□□ 0.96
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCC1P33527 1531 aa21.03■□□□□ 0.96
LRRTM1-201ENST00000295057 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.03■□□□□ 0.96
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
LRRTM1-201ENST00000295057 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
LRRTM1-201ENST00000295057 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
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LRRTM1-201ENST00000295057 FANCAO15360 1455 aa20.99■□□□□ 0.95
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