RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.74■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.73■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 FOXD1Q16676 465 aa25.72■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.71■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC7Q96M83 1385 aa25.71■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 NCOA1Q15788 1441 aa25.7■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 MRS2Q9HD23 443 aa25.69■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.68■■□□□ 1.7
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CNIH3-201ENST00000272133 AKNAQ7Z591 1439 aa25.66■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.66■■□□□ 1.7
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CNIH3-201ENST00000272133 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.57■■□□□ 1.68
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CNIH3-201ENST00000272133 ARID3CA6NKF2 412 aa25.56■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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CNIH3-201ENST00000272133 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.55■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.55■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 MIA2Q96PC5 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 GRIN2AQ12879 1464 aa25.5■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CNIH3-201ENST00000272133 DAPK1P53355 1430 aa25.46■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.46■■□□□ 1.67
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CNIH3-201ENST00000272133 DISP1Q96F81 1524 aa25.41■■□□□ 1.66
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CNIH3-201ENST00000272133 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
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CNIH3-201ENST00000272133 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.35■■□□□ 1.65
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CNIH3-201ENST00000272133 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.32■■□□□ 1.64
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CNIH3-201ENST00000272133 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.19■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.19■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 JPH4Q96JJ6 628 aa25.18■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 TMC1Q8TDI8 760 aa25.18■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 PKD2Q13563 968 aa25.16■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.16■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.13■■□□□ 1.61
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CNIH3-201ENST00000272133 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.11■■□□□ 1.61
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CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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CNIH3-201ENST00000272133 KIF15Q9NS87 1388 aa25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.05■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 ADGRL2O95490 1459 aa25.05■■□□□ 1.6
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CNIH3-201ENST00000272133 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.03■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.03■■□□□ 1.6
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CNIH3-201ENST00000272133 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.02■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.01■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.01■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.01■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25■■□□□ 1.59
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