RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.74■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.73■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 FOXD1Q16676 465 aa25.72■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.71■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC7Q96M83 1385 aa25.71■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 NCOA1Q15788 1441 aa25.7■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 MRS2Q9HD23 443 aa25.69■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.68■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 AKNAQ7Z591 1439 aa25.66■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.66■■□□□ 1.7
CNIH3-201ENST00000272133 IQGAP2Q13576 1575 aa25.62■■□□□ 1.69
CNIH3-201ENST00000272133 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.61■■□□□ 1.69
CNIH3-201ENST00000272133 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.57■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 ARID3CA6NKF2 412 aa25.56■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.55■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.55■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 MIA2Q96PC5 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
CNIH3-201ENST00000272133 GRIN2AQ12879 1464 aa25.5■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 DAPK1P53355 1430 aa25.46■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.46■■□□□ 1.67
CNIH3-201ENST00000272133 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 ROCK1Q13464 1354 aa25.42■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 DISP1Q96F81 1524 aa25.41■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC5O15440 1437 aa25.4■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CNIH3-201ENST00000272133 SYNJ2O15056 1496 aa25.39■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 CEP170Q5SW79 1584 aa25.38■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA0556O60303 1618 aa25.37■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.37■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.36■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 NUDCQ9Y266 331 aa25.36■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.35■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 FBLN2P98095 1184 aa25.35■■□□□ 1.65
CNIH3-201ENST00000272133 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.32■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.31■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.31■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 NBR1Q14596 966 aa25.31■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 USP47Q96K76 1375 aa25.3■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 PZPP20742 1482 aa25.3■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 MBD5Q9P267 1494 aa25.28■■□□□ 1.64
CNIH3-201ENST00000272133 NUP160Q12769 1436 aa25.26■■□□□ 1.63
CNIH3-201ENST00000272133 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CNIH3-201ENST00000272133 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CNIH3-201ENST00000272133 KDM5CP41229 1560 aa25.2■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 KIF14Q15058 1648 aa25.19■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.19■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.19■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 JPH4Q96JJ6 628 aa25.18■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 TMC1Q8TDI8 760 aa25.18■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 PKD2Q13563 968 aa25.16■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.16■■□□□ 1.62
CNIH3-201ENST00000272133 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.13■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.11■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.08■■□□□ 1.61
CNIH3-201ENST00000272133 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 KIF15Q9NS87 1388 aa25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.07■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.05■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 ADGRL2O95490 1459 aa25.05■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 CHD1O14646 1710 aa25.04■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.03■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.03■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.02■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.01■■□□□ 1.6
CNIH3-201ENST00000272133 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.01■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.01■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.5 ms