RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263663.9

TAF1B-201, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TAF1B, Length 2,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1B-201ENST00000263663 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.91■■□□□ 1.42
TAF1B-201ENST00000263663 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TAF1B-201ENST00000263663 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.89■■□□□ 1.42
TAF1B-201ENST00000263663 MIER1Q8N108 512 aa23.89■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.87■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 ROCK1Q13464 1354 aa23.87■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.85■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 TRIM52Q96A61 297 aa23.85■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.84■■□□□ 1.41
TAF1B-201ENST00000263663 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.82■■□□□ 1.4
TAF1B-201ENST00000263663 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.82■■□□□ 1.4
TAF1B-201ENST00000263663 TONSLQ96HA7 1378 aa23.81■■□□□ 1.4
TAF1B-201ENST00000263663 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TAF1B-201ENST00000263663 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.75■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 ABCC2Q92887 1545 aa23.75■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 NCOA1Q15788 1441 aa23.75■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.73■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.73■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 ADGRL2O95490 1459 aa23.73■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 FOXD1Q16676 465 aa23.72■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 PREX2Q70Z35 1606 aa23.71■■□□□ 1.39
TAF1B-201ENST00000263663 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.69■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.67■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.66■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.65■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.65■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TAF1B-201ENST00000263663 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 PZPP20742 1482 aa23.63■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.62■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 MBD5Q9P267 1494 aa23.61■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.61■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.6■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.59■■□□□ 1.37
TAF1B-201ENST00000263663 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.58■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.56■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.56■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 TSPY4P0CV99 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 TSPY10P0CW01 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 KCNH8Q96L42 1107 aa23.54■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 KIF15Q9NS87 1388 aa23.52■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.52■■□□□ 1.36
TAF1B-201ENST00000263663 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TAF1B-201ENST00000263663 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.5■■□□□ 1.35
TAF1B-201ENST00000263663 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.47■■□□□ 1.35
TAF1B-201ENST00000263663 PKD2Q13563 968 aa23.45■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 NUP155O75694 1391 aa23.45■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.43■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.43■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.42■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.42■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 PLCH2O75038 1416 aa23.42■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.4■■□□□ 1.34
TAF1B-201ENST00000263663 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.38■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 PLXNC1O60486 1568 aa23.36■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 ABCC1P33527 1531 aa23.36■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.35■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.33■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.33■■□□□ 1.33
TAF1B-201ENST00000263663 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.33■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 UNC13BO14795 1591 aa23.31■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.3■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 OSCARQ8IYS5 282 aa23.29■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.27■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.27■■□□□ 1.32
TAF1B-201ENST00000263663 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.26■■□□□ 1.31
TAF1B-201ENST00000263663 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.25■■□□□ 1.31
TAF1B-201ENST00000263663 ASXL2Q76L83 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
TAF1B-201ENST00000263663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 9.7
TAF1B-201ENST00000263663 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.22■■□□□ 1.31
TAF1B-201ENST00000263663 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TAF1B-201ENST00000263663 FANCAO15360 1455 aa23.2■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.2■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 ERBINQ96RT1 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 ANP32CO43423 234 aa23.2■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.2■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 AFAP1Q8N556 730 aa23.19■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.18■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 PLA2R1Q13018 1463 aa23.14■■□□□ 1.3
TAF1B-201ENST00000263663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.13■■□□□ 1.29
TAF1B-201ENST00000263663 CCDC7Q96M83 1385 aa23.13■■□□□ 1.29
TAF1B-201ENST00000263663 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.12■■□□□ 1.29
TAF1B-201ENST00000263663 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TAF1B-201ENST00000263663 ADGRL1O94910 1474 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms