RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 TMF1P82094 1093 aa11.71□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC7Q96M83 1385 aa11.71□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 NLRP13Q86W25 1043 aa11.69□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.69□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 HFM1A2PYH4 1435 aa11.69□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 WDR97A6NE52 1622 aa11.69□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 HMGXB3Q12766 1538 aa11.69□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 20.4
TTLL4-201ENST00000258398 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.68□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 CFTRP13569 1480 aa11.67□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 PKD2Q13563 968 aa11.67□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.66□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 CFAP53Q96M91 514 aa11.66□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.66□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.65□□□□□ -0.54
TTLL4-201ENST00000258398 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.65□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 22.2
TTLL4-201ENST00000258398 NCOA2Q15596 1464 aa11.64□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.64□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 USP47Q96K76 1375 aa11.63□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 RGS3P49796 1198 aa11.63□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.63□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 PDE4AP27815 886 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 PTMSP20962 102 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 RGL3Q3MIN7 710 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 FOXD1Q16676 465 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 MIA2Q96PC5 1412 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 NUP155O75694 1391 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.6□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTLL4-201ENST00000258398 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.58□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 GSE1Q14687 1217 aa11.57□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 CFAP44Q96MT7 982 aa11.57□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 FAM161AQ3B820 660 aa11.57□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 NGEFQ8N5V2 710 aa11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 MAPKBP1O60336 1514 aa11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 GOLGA2Q08379 1002 aa11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 HSCBQ8IWL3 235 aa11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 ARXQ96QS3 562 aa11.56□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.55□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.55□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.54□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.54□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.54□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 NAIPQ13075 1403 aa11.53□□□□□ -0.56
TTLL4-201ENST00000258398 HECW1Q76N89 1606 aa11.52□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 KANK1Q14678 1352 aa11.52□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CASC1Q6TDU7 716 aa11.52□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CUL7Q14999 1698 aa11.51□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.51□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.51□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.5□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.5□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 GBP4Q96PP9 640 aa11.5□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 ROCK1Q13464 1354 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 AAMPQ13685 434 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 AKNAQ7Z591 1439 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 MSH5O43196 834 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CRBNQ96SW2 442 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 NCOA1Q15788 1441 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TTLL4-201ENST00000258398 E9PSI1 815 aa11.46□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.46□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.45□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 STAC3Q96MF2 364 aa11.45□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.45□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.45□□□□□ -0.58
TTLL4-201ENST00000258398 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms